DNA单链磷硫酰化修饰-感应修饰限制系统的工作机理
近日,武汉大学药学院教授王连荣课题组在《自然·微生物学》在线发表了细菌DNA磷硫酰化领域的最新研究成果,首次揭示了一套全新的磷硫酰化限制-修饰系统——DNA单链磷硫酰化修饰Ssp系统,并解析了感应基因组修饰抗噬菌体系统的分子机制。
细菌磷硫酰化限制-修饰系统是细菌抵御外源DNA的一种细胞防御机制,由修饰蛋白DndABCDE与限制蛋白DndFGH组成,在细菌中广泛分布。
研究人员从探索海洋弧菌的高频单链磷硫酰化修饰入手,通过比较基因组学、细菌分子遗传学等手段,鉴定出了以SspABCD为修饰部分、SspE为限制部分的单链磷硫酰化限制-修饰系统。
研究人员表示,该Ssp系统在修饰和限制部分与之前发现的磷硫酰化Dnd系统迥然不同,该系统赋予宿主抑制噬菌体入侵的能力。此外,通过揭示SspB蛋白的DNA缺刻酶活性、SspE的感应磷硫酰化修饰的NTP水解酶活性,研究人员还解析了该系统DNA磷硫酰化修饰与限制两部分功能耦合的分子机理。
SspABCD作为修饰蛋白在宿主基因组DNA上产生磷硫酰化修饰,SspE作为限制部分能够感应基因组DNA上的磷硫酰化修饰从而区别宿主自身与外源的遗传物质,并利用其核酸酶活性对入侵噬菌体的DNA进行大范围的缺刻从而抑制噬菌体的复制和繁殖。
研究人员表示,Ssp系统的新型修饰基因和修饰机制、以及感应磷硫酰化修饰的独特防御方式是独立于传统Dnd以及以往其它限制修饰的全新系统。该研究集中了新基因簇的发倔、新型蛋白功能的鉴定以及新型感应修饰防御系统的解析等关键成果,开拓了磷硫酰化修饰以及细菌防御系统研究新的领域。
迄今规模最大的古代人类DNA研究表明,人类进化在过去1万年里明显加快。这项由美国哈佛医学院的群体遗传学家DavidReich联合主导的研究,4月15日发表于《自然》。研究人员在涵盖欧洲和中东地区的古代......
近日,中国科学院青岛生物能源与过程研究所单细胞中心与中国科学院天津工业生物技术研究所合作,研究开发了一种集成的、高灵敏度且高通量的错误校正平台eMBS。能够通过理性设计工程化MutS蛋白并结合磁珠分离......
据报道,上个月法国发生的一起案件,在一把枪上发现了同卵双胞胎兄弟的DNA,但他们拥有相同的DNA,所以传统的DNA检测方法,无法确定DNA属于哪位兄弟。在法国一起刑事审判中,传统的DNA检测未能区分出......
27日的《科学》杂志发表了一项研究,揭示了人类基因组中一类可“跳跃”的DNA片段——被称为遗传“寄生虫”的LINE-1(L1)元件,如何成为破坏癌症基因组稳定性的主要力量。基因组的不稳定正是癌症演化的......
一艘沉没于150年前的船经历了怎样的航程?科研人员从出水瓷瓶内的沉积物中,“打捞”出了它的生命史。通过对长江口二号沉船出水青花双耳瓶中的土壤沉积物进行环境因子与沉积物古DNA分析,来自复旦大学、华东师......
在近日一项发表于《自然》的研究中,科学家绘制出迄今最详尽的人类活细胞内DNA折叠、环状缠绕和移动的图谱,展示了基因组结构随时间推移的变化情况,揭示了隐藏的基因调控机制,是了解DNA结构如何塑造人类生物......
图基于卷对卷流体的新一代快速低成本基因测序技术在国家自然科学基金项目(批准号:22027805、22334004、22421002)等资助下,福州大学杨黄浩、陈秋水团队与华大生命科学研究院秦彦哲、章文......
荷兰乌得勒支大学研究人员开发出一款全新荧光传感器,可在活细胞乃至活体生物中实时监测DNA损伤及修复过程,为癌症研究、药物安全测试和衰老生物学等领域提供了重要的新工具。相关成果发表于新一期《自然·通讯》......
三维基因组互作与表观遗传修饰是基因表达调控的重要因素,其动态变化与细胞生长发育及癌症等疾病的发生发展密切相关。解析染色质在活细胞内的时空动态,是理解基因调控机制的重要科学问题。现有基于CRISPR-C......
1812年,法国皇帝拿破仑一世从俄罗斯莫斯科撤退时,其大部分军队因饥饿、疾病和寒冷的冬天而损失殆尽。如今,对这撤退途中丧生的30万士兵的部分遗骸的DNA的分析发现,两种未曾预料到的细菌性疾病很可能增加......