发布时间:2020-11-04 14:14 原文链接: 研究团队部合作建立衰老生物学多组学数据库

  随全球人口老龄化程度加剧,实现健康老龄化是目前亟待解决的社会问题和科学问题.近年来,随衰老相关研究成果不断增多及高通量测序技术日益发展,衰老相关多组学数据逐渐增多.然而目前,尚缺乏一个综合性的、整合衰老生物学多组学数据的数据资源库.

  中国科学院北京基因组研究所(国家生物信息中心)研究员鲍一明研究组、研究员张维绮研究组和中科院动物研究所研究员刘光慧研究组、研究员曲静研究组,合作建立Aging Atlas数据库.该数据库从常规转录组、单细胞转录组、表观基因组、蛋白质组及药物基因组等层面,整合衰老相关数据集,实现不同条件下基因表达调控随衰老变化趋势的汇聚融合.该数据库中,用户可实现交互查询和联合分析不同层次组学数据等功能;数据库将不断完善,建立多层次组学间的整合分析和数据呈现,并形成升级版本;数据库提供归属不同通路的衰老相关基因集,使用户可更深入全面地了解特定基因和通路在衰老生物学中的意义.Aging Atlas提供开放的数据共享平台,用户可在上传界面进行原始数据和处理后数据的上传操作,为实现全球数据共享提供便利.Aging Atlas的建立旨在为世界范围内衰老相关大数据的统一汇交、集中存储、安全管理、开放共享及前沿交叉研究和转化应用提供助力.相关研究成果以Aging Atlas: a multi-omics database for aging biology为题,在线发表在Nucleic Acids Research上.

  Aging Atlas数据库首次实现对与衰老相关的不同层次的多组学数据的收录和整合,其对用户免费开放,且持续实时更新,将有助于推动衰老相关的基础研究和临床转化应用的发展.Aging Atlas希望在广大科学工作者的支持下,不断吸纳更多高质量的衰老研究数据,以更好地服务衰老生物学和老年医学的发展.

  该数据库由北京基因组所、动物所、中科院干细胞与再生医学创新研究院、中科院干细胞与再生医学科学数据中心、首都医科大学宣武医院等合作完成.数据库的建设得到北京基因组所研究员杨运桂、慈维敏、任捷、韩大力,动物所研究员宋默识、周兵和副研究员冯桂海,中科院生物物理研究所所研究员陈畅,北京大学教授汤富酬教授、赵扬,浙江大学教授郭国骥和同济大学教授尹晓磊的指导和支持.研究工作得到科技部、国家自然科学基金委、中科院和北京市等的资助.

Aging Atlas数据库

相关文章

研究提出单细胞多组学新方法实现胰腺癌循环肿瘤细胞多维度解析

近日,中国科学院广州生物医药与健康研究院研究员林达等报道了新开发的单细胞多组学技术——Uni-C。该方法可在一个细胞中同时解析基因组大尺度结构变异(如SV、CNV、ecDNA)、小尺度突变(SNP/I......

超2200万元安徽医科大学多组学平台大型科研设备中标公布

近日,安徽医科大学科研实验中心多组学平台大型设备提升项目的多个中标结果公布。这些中标项目包括了核磁共振波谱仪、透射电子显微镜、场发射扫描电镜等大型科研仪器设备,总中标金额超2200万元。......

赛默飞尖端质谱平台,赋能美吉生物引领多组学研究新高度

在生命科学飞速发展的今天,赛默飞世尔科技(ThermoFisherScientific)凭借其领先的高端分析技术,正持续为前沿研究注入强大动力。作为行业标杆的美吉生物,一直专注于多组学检测技术的研发与......

创新引领结构蛋白质组学的进步,创新支持大小分子多组学的一机式需求,创新拓展数据挖掘的纵深

——专访布鲁克质谱业务高管:RohanThakur质谱业务总裁,StefanFoser全球制药行业副总裁,Jeff李剑峰大中国区总经理多组学的需求是推动质谱技术进步最重要的增长动力。当高分辨高置信度地......

科学家构建出中国种子性状数据库

植物性状是表征环境适应策略与资源分配模式的关键指标,为理解物种分布、群落构建及生态系统功能提供了重要基础。近年来,全球及区域尺度的植物性状数据库不断完善,推动了宏观生态学、功能生态学及生物多样性保护等......

中国医学科学院杨啸林:“中国尿计划”推动生物医学数据生态建设

2025年4月13日,“中国尿计划”第二次学术研究会在中国医学科学院基础医学研究所召开,会议采用线上线下结合的方式,吸引了北京、上海、深圳等多地近200位业界学者参与。值此之际,分析测试百科网专访了项......

“沉默肿瘤”首张全景分子图谱绘成

7日,记者从复旦大学附属肿瘤医院获悉,该院院长虞先濬教授联合北京大学肿瘤医院、中国科学院上海药物研究所、上海长海医院等单位的研究团队,历时5年成功绘制全球首张无功能性胰腺神经内分泌瘤多组学全景图谱,并......

全球最大数字微生物数据库建成

来自爱尔兰、法国和意大利的科学家携手,成功构建了全球最大的数字微生物库——“阿波罗”(APOLLO)。“阿波罗”囊括了247092个计算模型,其中包含迄今为止最全面的人体微生物组计算模型,有望增进科学......

给予下一代细致关爱中国新生儿多组学研究计划启动

近日,由中国科学院院士、生殖医学专家黄荷凤教授领衔的研究团队在杭州正式启动中国新生儿多组学研究计划(ChinaBabyOmics,CBO)。该计划预期到2030年建立涵盖100万名中国新生儿的多组学公......

首个免疫衰老多组学数据库设立

记者12月17日从中国科学院基因组所(国家生物信息中心)了解到,该所研究员张维绮团队、鲍一明团队与中国科学院动物研究所研究员刘光慧、曲静研究组合作,建立了免疫衰老领域首个多组学数据库Immunosen......