离子色谱仪分析高浓度基体中痕量离子和含有大有机分子样品时，要对样品作适当的前处理。
一、高浓度基体中痕量离子的分析：
如海水中阴离子的测定，最好的方法是对样品作适当的前处理。除去过量Clˉ的前处理方法有使样品通过Ag+型前处理柱除去Clˉ、进样前加AgNO3到样品中沉淀Clˉ和采用阀切换技术。阀切换技术是使样品中弱保留的组分和90%以上的Clˉ进入废液，只让10%左右的Clˉ和保留时间大于Clˉ的组分进入分离柱进行分离。
二、含有大有机分子样品的分析：
应于进样前除去有机物，较简单的方法是在线阀切换除去有机基体等。
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