发布时间:2020-05-18 23:37 原文链接: 种子的SSR检测——高通量前处理解决方案

美国SPEX SamplePrep公司拥有60余年的专业样品前处理仪器生产经验和专业背景。SPEX GENO高通量组织研磨仪,开始是专门为杜邦旗下先锋良种农业(PIONEER)植物样品而研发。

SSR(又称微卫星DNA)标记,由于其共显性遗传特点,可以鉴定杂合子和纯合子。该标记法需要DNA量少,实验重复性好,可靠性高,操作简便、经济,因而已经成为种子鉴定中最常用的分子鉴定方法,并已经出现在一些种子真实性和纯度检测的标准中。

为了真正实现极高通量检测,在96孔深孔板的单孔中如能对单粒种子成功粉碎将是非常理想的。我们知道要将种子磨碎并不难,但要在如此狭小的空间内将坚硬的种子磨碎就不那么容易实现了。SPEX高通量组织研磨仪能轻松达到这一目的。培安公司应用工程师已整理出上百种样品的最佳前处理方案,下图为部分种子的研磨效果(每个图都是96孔深孔板单孔研磨单粒种子的结果):

         

值得注意的是,大麦、绿豆、黄豆这些带皮的种子,无须剥皮,研磨完成外皮自然脱落;像黄豆这样坚硬的种子,在单孔也成功粉碎;像葵花籽这样油性的种子,研磨结果虽有些结块,但是也呈泥浆状,拥有很好的细度。唯独玉米种子单粒较大,无法放入深孔板单孔中,但当我们将玉米种子放入15ml管中,也获得了下图的研磨效果:

      玉米

我们知道,在进行种子真实性和纯度检测时,每个品种需要做一定数量的重复,尤其纯度检测时,至少需要100粒种子。在SSR分子标定步骤的第一步就需要破碎种子并提取DNA,这是一个非常繁重的手工劳动。如果SPEX Geno 加入工作,就可以一个人在几分钟之内就获得所有待测种子的模板DNA!而这往往是需要一个人几个工作日的劳动量!

Geno 2010一次可处理6块96孔深孔板,也就是说一次即可完成576个种子的DNA提取;一次可处理24个15ml管,像玉米这样的大颗粒种子,一次也可以做24个不同样品的DNA提取。

种子检测领域和遗传育种领域的样品通量极高是众所周知的,也是让科研工作者颇为伤脑筋的问题。培安技术中心的应用工程师可根据您的样品为您提供方案,使得所有繁琐的前处理问题迎刃而解。


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