2014年4月14日,第五届上海CPSA会前研讨会——基础蛋白质分析会议在上海复旦大学医学院隆重举办,吸引来自蛋白质组研究领域的专家学者参加。本次研讨会由New Objective公司赞助,与复旦大学生物医学研究院联合举办,诚邀来自Scripps Institute的John Yates博士、复旦大学杨芃原教授、New Objective公司总裁Gary Valaskovic博士、国家蛋白质科学中心(上海)黄超蘭博士、华东师范大学廖鲁剑教授带来关于蛋白质研究方法、定量研究等方面的精彩纷呈的报告。分析测试百科网作为此次活动的支持媒体,对2014 CPSA会议进行全程报道。
研讨会现场
New Objective公司中国区总裁王勇为博士
New Objective公司中国区总裁王勇为博士上台讲话,预祝2014 CPSA圆满召开
复旦大学杨芃原教授
接着,来自复旦大学的杨芃原教授上台致辞,对参加本次研讨会的各位嘉宾表示感谢,隆重介绍演讲嘉宾。
New Objective公司总裁Gary Valaskovic博士
New Objective公司总裁Gary Valaskovic博士为大家带来《什么是Spray DNA?》的演讲报告。ESI即电喷雾离子源,ESI-MS是较常用的一种离子化方式,具备高浓度灵敏探测器。
Gary Valaskovic博士在报告中指出,Spray DNA能控制整体ESI,Spray DNA具备稳定、低噪音、低RSD,高效收集,具重现性,流速高效快速和稳定等特点,同时纳喷雾发射器的位置非常重要,是从液体尖部发射出去,而样品制备,分离和离子化的整合也十分关键。
同时也指出,纳喷雾/LC-MS/MS关键技术方法开发还有部分不足有待提高,比如延迟更短、较低流速/微流控一体化等。
最后,Gary Valaskovic博士重点介绍了New Objective公司的PicoChip产品,PicoChip易于使用,即插即用,只需一次连接,可温控,工厂确保电压有效连接,重现性高。
Scripps Institute的John Yates博士
来自Scripps Institute的John Yates博士为与会者带来《大规模蛋白质组学的方法和数据分析》的精彩报告。
John Yates博士指出,蛋白质组学研究是质谱、序列和电离技术的融合。从1998年研究开始,蛋白质鉴定、肽修饰、蛋白质基因组学、序列变异、搜库等综合完整的基因组学新技术,形成集质谱、计算群、自动化ACQ数据传输、生化手段、大规模分离于一体的完整蛋白质组学。
目前还有很多蛋白质方面的问题暂无结果,但可以通过全基因组测序来解决。John Yates博士介绍了蛋白质组分析方法,包括:能对数据分析步骤的软件工具;ProLuCID——具有卓越的灵敏度和特异性;IP2——整合蛋白质组运输,能做到定量分析和多数据比较;定量分析工具;patternLab——功能分析工具等。
国家蛋白质科学中心(上海)黄超蘭博士
来自国家蛋白质科学中心(上海)质谱系统主任、中心主任助理、研究员黄超蘭博士带来《蛋白质翻译后修饰(PTM)分析的方法和数据处理》的精彩报告。
黄超蘭博士指出,PTM 是蛋白质生物合成中的其中一个步骤,在蛋白质翻译过程后发生的,是决定蛋白质功能的关键过程,是导致蛋白质复杂性的主要因素。现在,已经有超过300中不同类型的蛋白质翻译后修饰,其中不少是已知在细胞生理和疾病的关键角色。PTM包含四种方式,添加——糖类、酯类、磷酸基团等;酶切;AAS化学性质改变;结构改变。
报告指出,由于PTMs的不稳定性PTM紧密集中、通过得到特征离子等,可以通过对PTM MS数据的质量控制进行精确注释,就能够通过质谱辨别PTMs。
最后,黄超蘭博士指出,未来PTM还有很多挑战,比如实现PTM更高的灵敏度、更宽的蛋白丰度动态范围等;研发更稳健的定量方法来研究PTM动态,组织和开发更多的蛋白质PTM类型分析等。
复旦大学杨芃原教授
来自复旦大学的杨芃原教授带来《基于质谱强度对肽浓度的定量蛋白质组学》。杨芃原教授的报告首先从MS强度和(包含同位素峰)/理论上应该发现的肽段数提出理论思考,在肽浓度和MS响应的校正曲线。
报告显示一系列理论支持和实验数据分析。qCONCAT的MRM分析,可一次表达超过20蛋白质对应肽段,并同时引进同位素标记;标准肽段和目标蛋白质酶切同步进行,可消除因样本制备过程带来的偏差。
华东师范大学廖鲁剑教授
来自华东师范大学的廖鲁剑教授上台作《应用稳定同位素为基础的定量质谱为神经系统疾病解码的路径》。廖鲁剑教授详细介绍了蛋白质定量方法,包括Metabolic labeling(SILAC、SILAM)、Chemical labeling(氧18)、Chemical labeling(iTRAQ、TMT、ICAT)和Label Free等蛋白质定量方法。
会议尾声,杨芃原教授上台作报告总结,并感谢每一位嘉宾的精彩演讲。
会后,CPSA创建者Mike Lee先生和New Objective公司总裁Gary Valaskovic博士与每一位演讲嘉宾合影留念。
CPSA创建者Mike Lee先生、New Objective公司总裁Gary Valaskovic博、Scripps Institute的John Yates博士合影
CPSA创建者Mike Lee先生、New Objective公司总裁Gary Valaskovic博士、复旦大学杨芃原教授合影
CPSA创建者Mike Lee先生、New Objective公司总裁Gary Valaskovic博士、国家蛋白质科学中心(上海)黄超蘭博士合影
CPSA创建者Mike Lee先生、New Objective公司总裁Gary Valaskovic博士、华东师范大学廖鲁剑教授合影
CPSA创建者Mike Lee先生、New Objective公司总裁Gary Valaskovic博士、复旦大学生物医学研究院化学系金红博士合影
集体合影
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