1、卡那霉素注射制剂与其他氨基糖苷类合用或先后局部或全身应用，可增加耳毒性、肾毒性以及神经肌肉阻滞作用。
2、卡那霉素注射制剂与神经肌肉阻断药合用，可加重神经肌肉阻滞作用，导致肌肉软弱、呼吸抑制等。
3、卡那霉素注射制剂与卷曲霉素、顺铂、依他尼酸、呋塞米或万古霉素(或去甲万古霉素)等合用，或先后连续局部或全身应用，可能增加耳毒性与肾毒性。
4、卡那霉素注射制剂与头孢唑林钠合用会增加肾毒性。
5、卡那霉素注射制剂与头孢噻吩或头孢唑林局部或全身合用可能增加肾毒性。
6、卡那霉素注射制剂与多粘菌素类注射剂合用，或先后连续局部或全身应用，可增加肾毒性和神经肌肉阻滞作用。
7、其他肾毒性药物及耳毒性药物均不宜与本品合用或先后应用，以免加重肾毒性或耳毒性。