临床表现以腹泻最为突出，可有腹部不适和厌食、恶心、呕吐、腹痛。腹泻呈稀水样便，每日5～7次，可有血便或脂肪泻及吸收不良综合征。外胚层异常，一般在消化道症状之前数周至数月出现，表现为指（趾）甲颜色改变，可为棕色、白色、黄色或黑色；指甲表面呈鳞状、皱状或匙状，可有萎缩变薄、裂开、松动、脱落。皮肤色素沉着，呈棕色斑，直径由几毫米至10毫米不等。神经系统症状可有肢体麻木、刺痛，部分有味觉、嗅觉减退或消失，个别有癫痫样发作，甚至昏厥。另外，有相当一部分患者出现吸收不良综合征、蛋白丢失性肠病，因此有营养不良、低蛋白血症、维生素缺乏以及浮肿、贫血等临床症状。本病常见的并发症有消化道出血、感染、肠套叠、癌变和血栓形成等。