破坏微生物的细胞膜，使细胞内的蛋白质变性，并可抑制微生物细胞的呼吸酶系与电子传递酶系的活性。
尼泊金酯的抑菌活性主要是分子态起作用，且其分子内的羟基已经酯化，不再电离，所以它在pH3～8 的范围内均有很好的抑菌效果。而苯甲酸和山梨酸均为酸性防腐剂，它们在pH＞ 5。5 的产品中抑菌效果很差。尼泊金酯的安全性很高，以乙酯为例，其LD50为5000mg/ kg,ADI 为0～10mg/ kg，而苯甲酸的LD50为2530mg/ kg,ADI 为0～5mg/ kg，山梨酸的LD50 为7630mg/ kg,ADI为0～25mg/ kg，