柠檬酸钙的溶解性好，不需要胃酸的活化就能被吸收，极易转化为离子钙形式，被人体直接吸收利用。《美国临床药学杂志》1993年的研究报告中指出，柠檬酸钙的“生物利用率”远比传统的碳酸钙好，柠檬酸钙的血钙浓度在服用钙片后的数小时内都比服用碳酸钙的高；报告还指出，柠檬酸钙对甲状旁膀素的抑制作用也比碳酸钙高出了50%，这进一步证明了柠檬酸钙会很快地在血液中出现高峰，显示出快速的吸收率，
一般而言，柠檬酸钙的“生物利用率”是碳酸钙的2.5倍。另外，碳酸钙在服斥后容易产生胃胀气，所以最好在饭后服用，并且碳酸钙没有胃酸的分解也很难被吸收。柠檬酸钙不但没有这些缺点，相反却有预防结石的优点，这是由于柠檬酸钙在血液中的溶解度比生成结石的草酸钙高，因此柠檬酸钙会抢夺结石成分中的钙，起到预防产生草酸钙结石的功能。
不过，柠檬酸钙的成本比碳酸钙要高，并且，柠檬酸钙所含的钙的比率为21%，比碳酸钙的40%低了将近1倍。所以，如果要摄取相同重量的钙，摄取柠檬酸钙的量就必须比碳酸钙多将近1倍。