(1)注射用甲磺酸帕珠沙星可抑制茶碱在肝脏的代谢，使茶碱的血药浓度升高，可能发生茶碱中毒症状，如胃肠道反应、头痛、心律不齐、痉挛等，所以病人需密切观察，两药合用时应密切观察茶碱的血药浓度。
(2)注射用甲磺酸帕珠沙星与苯基乙酸类、二乙酮酸类、非类固醇消炎镇痛剂合用时可能发生痉挛，所以应密切观察，如出现症状应立即停药并采取解痉治疗。当出现痉挛时，应终止两药的合用，保持呼吸道通畅，并使用抗痉挛的药物进行治疗。
(3)注射用甲磺酸帕珠沙星与华法林合用时，可增强华法令的作用，从而延长凝血时间，所以用药时应密切观察并做凝血时间试验。
(4)注射用甲磺酸帕珠沙星与丙磺酸合用时，血清半衰期延长，AUC增加，但血药峰浓度无明显变化。