阿德福韦酯在细胞内被磷酸激酶转化为了具有抗病毒活性的二磷酸盐,通过对天然底物二脱氧三磷酸腺苷的竞争作用,抑制HBV聚合酶(逆转录酶),吸收且掺入到病毒DNA,中止其DNA链的延长,由此抑制HBV的复制。其对宿主DNA聚合酶α和γ有轻微的抑制作用。体外对HBV转染肝细胞的IC50是0.2至2.5μM。对于HBV YMDD变异毒株,阿德福韦酯与拉米夫定无交叉耐药性。