鳞状上皮细胞癌抗原的临床意义：血清SCCA测定对各种鳞状上皮细胞癌的诊断均有很高的特异性，是外阴、阴道和宫颈鳞状上皮细胞癌的有效和敏感的标记物。对外阴及阴道的原发癌，敏感性40%~50%；对原发性子宫颈鳞癌，诊断敏感性可达50%~70%；对复发癌诊断的敏感性可达65%~85%。宫颈癌患者血清SCCA浓度高低与临床期别呈正相关，SCCA水平的升降与疾病进展或好转相致。动态监测血清SCCA水平可作为宫颈癌病情监测的一个指标，宫颈癌患者治疗后血清SCCA水平再次上升，或治疗前血清SCCA阴性，治疗后SCCA反呈阳性反应时应考虑为癌瘤复发，且血清SCCA水平升高较临床出现复发迹象或影像学提示肿瘤复发为早。
值得注意的是，正常体液如汗液、唾液和其他体液内亦可有SCCA，若标本受到此类体液的污染，甚至喷嚏亦可能污染标本而导致假阳性，故SCCA升高的标本宜作重复测定。