已有大量研究及实际应用证实,鼠李糖脂可以用在农作物、蔬菜、水果、花卉上用于刺激生长、辅助吸收营养、增加农药及肥料作用效果等，并经证实对人及动物无毒副作用。
鼠李糖脂生物表面活性剂可作为润湿剂应用于叶面肥的生产上。因为许多植物叶片都覆有一层蜡质层，使叶片表面成为一种保护表面，鼠李糖脂生物表活剂可作为润湿剂，添加于叶面肥料中，以疏水基通过色散力吸附在蜡质层的表面,亲水基则伸入肥液中形成定向吸附膜取代了疏水的蜡质层，改善叶面肥料在蜡质层的润湿状况，使肥料充分铺展，促进肥料营养物质最大限度的被吸收利用。
鼠李糖脂生物表活剂具备将部分微量元素鳌合的功能，在弱碱性环境下电离出的羧基可固定根系周围的微量元素，降低微量元素在土壤中快速散失的可能性，保证了肥料的长效性。（Root Uptake of Lipophilic Zinc#Rhamnolipid Complexes，J. Agric. Food Chem. 2008, 56, 2112–2117）
对碱性土壤环境改善可以起到有效作用，是碱性土壤改性良好的添加剂。利用Rh在碱性条件下，电离出Rh-与H+的性能，与碱性土壤中的OH-中和改善土壤的碱性，从而改变土壤板结环境条件。
因为鼠李糖脂有润湿剂的作用及良好的表面活性，可应用到农药上起润湿、铺展及渗透作用。另外，对于一些农药残留，鼠李糖脂具有可将其降解的能力。
此外，鼠李糖脂具有良好的抑制真菌的作用（已发表过的文献中多次提到），用于农作物拌种和抑制真菌、霉菌的实验，已被证实。
国外对鼠李糖脂在农业方面的应用比较常见，美国纽约州环保局通过了生物药含鼠李糖脂的注册检测。（EPA，注册号72431-1）