发布时间:2019-02-25 14:12 原文链接: 精神分裂症功能基因组学研究中取得进展

图片.png

  精神分裂症是一种以阳性症状、阴性症状和认知障碍为主要特征的严重精神疾病,目前影响了全球约1%的人口。由于病因复杂,反复发作以及大多在青壮年发病,精神分裂症严重影响患者生活,同时也给患者家属和社会带来了沉重的经济和精神负担。精神分裂症的遗传力高达80%左右,表明遗传因素在精神分裂症的发生中有重要作用。近年来,全基因组范围内的关联研究(GWAS)已鉴别到超过180个与精神分裂症显着相关的遗传变异(单核苷酸多态性,SNPs),然而由于连锁不平衡及基因调控的复杂性,这些鉴别到的风险遗传变异通过何种机制影响精神分裂症发生目前仍不清楚。

  为了进一步深入研究目前鉴别到的风险遗传变异如何影响基因的表达和精神分裂症易感,中国科学院昆明动物研究所罗雄剑课题组利用功能基因组学(Functional Genomics)方法系统地研究了精神分裂症易感遗传变异对基因的调控机制。通过整合染色质免疫共沉淀—高通量测序(ChIP-Seq)和位置权重矩阵(PWM)数据,一共鉴别到132个打断与转录因子结合的风险单核苷酸多态性(SNPs)。与功能基因组学结果一致,报告基因实验和等位基因特异性表达分析支持这些打断转录因子结合的风险单核苷酸多态性的调控效应。进一步分析表明,这132个打断转录因子结合的SNPs中的97个在人脑组织中与基因的表达显着相关。

  该研究初步揭示了精神分裂症风险遗传变异对靶基因的调控机制(包括广泛的打断与POLR2A和CTCF等转录因子的结合),并鉴别到一批受精神分裂症风险遗传变异调控的靶基因。该研究为进一步深入解析精神分裂症的遗传机制提供了一个新的思路,同时这些新的发现为精神分裂症遗传机制和致病机理研究及药物开发提供了重要数据。

  该研究以Functional genomics reveal gene regulatory mechanisms underlying schizophrenia risk 为题,在线发表在《自然-通讯》(Nature Communications)上。昆明动物所研究实习员霍永霞、博士研究生李世武为文章的共同第一作者,罗雄剑为通讯作者。该研究得到中科院战略先导专项(动物复杂性状的进化解析与调控)、国家重点研发项目、国家自然科学基金、云南省重点研究项目的资助。


相关文章

人工智能新模型可解码DNA隐藏“语言”

科技日报北京8月6日电 (记者张佳欣)DNA包含了维持生命所需的基础信息。理解这些信息是如何存储和组织的,一直是20世纪最大的科学挑战之一。现在,借助GROVER这一基于人类DNA训练的新型......

精神分裂症患者和儿童的信息选择机制获揭示

制 近期,浙江大学心理与行为科学系陈辉教授课题组与合作者在《NatureMentalHealth》《NatureCommunications》接连发表了两篇论文,在人类注意和工作记忆研究领域......

毕业4年后,她举报导师抢了论文一作

近日,一位名叫郑雅婷的女生在多个社交平台发文称,她的硕士生导师、江南大学生物工程学院副教授杨某某将本来属于她的论文第一作者署名占为己有。那是一篇发表于2020年6月的《分子遗传学和基因组学杂志》(Mo......

英国成立功能基因组学实验室

近日,英国科研与创新署(UKRI)宣布,医学研究理事会(MRC)、剑桥大学米尔纳治疗研究所(MTI)等联合成立功能基因组学实验室,作为英国卓越研究中心和国家资源中心,汇集英国生命健康领域学术界、产业界......

科学家绘制小细胞肺癌蛋白基因组学图谱

肺癌是全球癌症致死的首位原因,而小细胞肺癌约占肺癌总数的15%,是所有肺癌亚型中恶性程度最高、预后最差的亚型,5年生存率仅为5%。与非小细胞肺癌形成鲜明对比,小细胞肺癌的治疗手段单一,患者总生存率低。......

我国科研人员绘制小细胞肺癌蛋白基因组学图谱

肺癌是全球癌症致死的首位原因,而小细胞肺癌约占肺癌总数的15%,是所有肺癌亚型中恶性程度最高、预后最差的亚型,5年生存率仅为5%。与非小细胞肺癌形成鲜明对比,小细胞肺癌的治疗手段单一,患者总生存率低。......

2023基因组学Top40公司股价同比下降7%,哪家却在逆势飞升?

基因组学公司股票在2023年普遍下跌,远落后于大盘。总体而言,基因组网前40名在2023年同比下跌了7%。与2022年相比,前40名暴跌34%。如果不是因为整体市场表现强劲,道琼斯工业平均指数(DJI......

未用药精神分裂症患者自杀行为与糖代谢受损的关系

自杀行为可以沿着一个连续体分类,包括频繁想要结束生命(自杀意念)、制定具体自杀计划(自杀规划)、自杀企图、最终完成自杀。已有研究表明,精神分裂症患者在早期精神病发作时,存在共病性自杀行为和葡萄糖代谢障......

南京师范大学国际合成生物学研究中心揭牌:擘画“一城三园”千亿蓝图

11月5日,南京师范大学国际合成生物学研究中心揭牌,诺贝尔化学奖得主、世界顶尖科学家协会主席罗杰·科恩伯格教授担任中心首席科学家。这一“官宣”,让百公里外的常州为之振奋:上月,由常州市政府、常州高新区......

Isoseq全长转录组测序助力拟南芥蛋白质异构体的发现

背景植物科学中常以高通量的方式(组学)研究生物体不同层次的复杂性,通常整合多组学数据以获得生物体发育或在不同环境条件下的生物学的准确图像。目前,全长异构体测序(Iso-Seq)与短读长转录组学和蛋白质......