线性离子阱质谱仪在应用上主要分为以下五点

　线性离子阱质谱仪是高通量分析的工具。结合多种解离技术，包括脉冲碰撞解离(PQD)和电子转移解离(ETD)，LTQ XL提供丰富的结构信息。广泛应用于蛋白质组学、代谢物鉴定、药物研发定量分析、法医和临床分析等领域。
 

　　线性离子阱质谱仪功能简介：

　　1、可升级的电子转移裂解(ETD)模块可以提供传统裂解方法无法得到的蛋白质翻译后修饰信息；

　　2、脉冲碰撞能量诱导解离(PQD)功能可以提供低质量端碎片离子信息；

　　3、高选择MS/MS分析给谱图在数据库和谱库检索更好的匹配，提高了结构确证的可靠性。另外快速极性切换，母离子相关MS3数据关联扫描，可以对翻译后修饰和代谢物组成的鉴定进行智能、快速分析，还可以和的回旋共振质谱组合成先进的多级高分辨杂交质谱仪；

　　4、自动数据依赖性多级质谱采集技术不仅为用户提供预测代谢物(母离子列表)结构信息，也能提供未预测到的代谢物结构信息。此外使用自动固定中性丢失数据依赖性(CNL)扫描触发三级质谱扫描能检测某一类的代谢物。使用MetworksTM 和Mass Frontier分析软件增强复杂基质中代谢物筛选和鉴别功能，使谱图解析更简便。
 

　　线性离子阱质谱仪离子化技术：

　　1、IonMax离子源：ESI(电喷雾电离)，APCI(大气压化学电离)和APPI(大气压光电离)探头都是基于革新的Ion Max离子源而设计。它具有超高性能，结构简单以及无需工具就可进行ESI和APCI探头更换的特点，探头在x，y，z三个方向均可调节。无论对于低流速还是高流速，都可以优化位置获得好的灵敏度。

　　2、满足各种需要的离子源配置：ESI(电喷雾电离源)，APCI(大气压化学电离源)，APPI(大气压光电离源)，纳喷电离源(NSI)。
 

　　线性离子阱质谱仪的主要应用：

　　1、应对代谢物鉴定和确证，线性离子阱质谱仪可自动查找到所有可能的代谢物。

　　2、基于离子/离子化学的电子转移解离(ETD)，线性离子阱质谱仪是实现此技术的仪器。ETD与CID互为补充，提高蛋白序列覆盖率；保护不稳定PTM翻译后修饰基团，简化数据分析；单次进样自动启动CID和ETD。

　　3、母离子智能选择：自动数据依赖多级质谱采集技术不仅能为用户提供预测代谢物(母离子列表)结构信息，也能提供提供未预测的代谢物结构信息。此外，使用自动固定中性丢失数据依赖性(CNL)扫描触发三级质谱扫描能检测某一类的代谢物。使用MetWorks和MassFrontier分析软件增强复杂基质钟代谢物筛选和鉴别功能，使谱图解析更加简便。

　　4、应对蛋白质组学和生物标记问题，ETD解离技术使LTQ XL成为蛋白质组学研究更强大的分析工具。

　　5、线性离子阱质谱仪可配置ETD裂解源，ETD能够为线性离子阱提供类似ECD的裂解碎片，在生成大量肽段碎片的同时，保护不稳定的PTM翻译后修饰集团，例如磷酸化翻译后修饰。ETD功能与赛默飞世尔线性离子阱的高离子储存量相结合，是蛋白质和肽类分析的新型有效工具。