组蛋白去乙酰化酶抑制剂（HDACIs）包括结构不同的化合物，是一组有针对性的抗癌药物。
当下发现的HDACi按其结构分为4类：
一、脂肪酸，如丁酸盐、丁酸苯酯和丙戊酸，其中丙戊酸被用作抗癫痫药物；
二、氧肟酸盐，如TSA是被发现的第1个能抑制HDACs的天然氧肟酸，SAHA [3] 与TSA结构相似，是食品药品管理局批准的第1个可以用于临床的制剂；
三、环肽，如天然产物缩酚酸肽FK-228、 apicidin和环氧肟酸；
四、苯酰胺类，如MS-275、 MGCD0103。有些HDACi如TSA、 SAHA属非选择性，可同时抑制Ⅰ类及Ⅱ类 HDACs；有些 HDACi属于选择性的，如 MS-275对Ⅰ类HDACs的抑制作用强于Ⅲ类HDACs，而对HDAC6、 HDAC8几乎没有影响。但是现阶段对于决定不同HDACs活性的组蛋白特异序列还知之甚少。