方法三
(1)收集细胞悬液(106细胞),低速离心(1000r/min,离心5min)。
(2)去上清,沉淀加0.4ml低渗缓冲液作用1h。
(3)13 000r/min,离心10min,将上清转移至另一Eppendorf管中,加等量50%异丙醇和0.5mol/L NaCl混匀,置液氮5min。
(4)12 000r/min,离心10min,弃上清,沉淀真空抽干。
(5)加TE 100μl,65℃加热10min,取20μl,加1~2μl上样缓冲液,电泳观察。
方法四
(1)收集细胞,1000r/min离心5min,去上清。
(2)用冰预冷的70%乙醇固定,可长期保存于-20℃冰箱。
(3)1000r/min离心5min,去除固定液,用约0.5ml的PBS重悬细胞。
(4)转入Eppendorf管中,同法离心,去上清。
(5)细胞用40μl PC缓冲液重悬,室温30~60min。
(6)1000r/min离心5min,吸上清于新的Eppendorf管中,真空浓缩15min。
(7)加入0.25% NP-40溶液3μl,1mg/ml RNase A溶液3μl,37℃,30min。
(8)加入3μl蛋白酶K,37℃,30min。
(9)加入12μl样品稀释液,含溴化乙锭的1.5%琼脂糖电泳,观察
2、琼脂糖凝胶电泳的定量检测
方法一:简易末端标记法
(1)按常规提取细胞DNA。
(2)在0.5ml的EP管中加入细胞DNA,反应体系如下:细胞DNA 0.5~1.0μg,10×缓冲液2μl,32P-dATP(或-dCTP)0.5μCi,Klenow聚合酶5U,双蒸水加至20μl。
(3)混匀后稍加离心,室温反应30min。
(4)加1μl 0.5mol EDTA终止反应。
(5)常规酚/氯仿/异戊醇抽提1次,无水乙醇沉淀DNA,真空抽干。
(6)溶于20μl的TE缓冲液中。
(7)取标记DNA在1.8%琼脂糖凝胶上点样,50V电泳约2h。
(8)电泳后的凝集置滤纸上烘干,进行放射自显影。
方法二:5’末端32P标记法
细胞DNA的提取
(1)细胞悬液离心后,沉淀加消化缓冲液0.5ml,50℃ 3~5h,或37℃过夜。
(2)用等体积的酚:氯仿:异戊醇抽提细胞裂解液。
(3)将水相转移至新的试管,加入150mmol/L乙酸钠和10mmol/L氯化镁。
(4)加入2倍体积的预冷无水乙醇,置液氮5min或-20℃ 12h。
(5)12 000r/min离心沉淀DNA,70%乙醇洗1次后,真空抽干。
(6)溶于20μl的TE缓冲液中。
(7)加入终浓度为10μg/ml RNase,37℃,30min。
(8)同法用等体积酚:氯仿:异戊醇抽提,乙醇沉淀,真空抽干。
(9)溶液20μl的TE缓冲液中,-20℃保存备用。DNA含量测定:用260nm波长紫外分光光度计:吸光单位为20时约为1mg/ml DNA。
3、DNA 5’末端脱磷酸
(1)取纯化的细胞DNA 10μg,然后加入:10×CIP 2μl(1U),双蒸水加至50μl。
(2)37℃水浴2h。
(3)90℃水浴5min以灭活CIP。
(4)用等体积酚:氯仿:异戊醇抽提,乙醇沉淀,真空抽干。
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