α-螺旋在DNA结合基序（DNA binding motifs）中有非常重要的作用，比如在锌指结构，亮氨酸拉链，螺旋-转角-螺旋等基序中都含有α-螺旋。
这是因为α-螺旋的直径为1.2nm，正好和B-DNA大沟的直径相等，所以能够和B型DNA紧密结合。
