ChemoMetec A/S的NucleoCounter是内置的荧光显微镜设计，检测与细胞核酸结合的荧光染料PI的信号。NucleoCounter分析的结果是总细胞浓度或死细胞浓度，取决于样品的处理。
◇碘化丙啶
碘化丙啶（PI）是一种荧光分子和高选择性DNA染料，PI可与双链DNA（dsDNA）高效结合，一旦与DNA结合，激发和发射光波长转换，与游离的 PI(没有结合DNA)相比，荧光强度提高20-30倍（提高了信噪比），从而显著提高测量精度。不同细胞（不同的细胞大小或细胞形态）的细胞核大小基本上是一致的，因而不需要校正。
◇碘化丙啶排斥法（PIE）
具有完整细胞膜的活细胞DNA实际上是不会被PI染上色，因而，活细胞在分析前需要破坏细胞膜；另一方面，死细胞的细胞膜可透过PI，因而死细胞不需要裂解就可以染上色。