细胞系的DNASTR谱_细胞系结果分析

GeneScan®和Genotyper®软件PowerMac计算机

本节包括 2 个主要领域：分析利用GeneScan^®分析软件中 DNA 程序收集软件收集到的原始数据，和利用Genotype^®软件为前面用GeneScan^®软件分析过的 DNA 谱中的指定等位基因名称。

1. 打开凝胶图像，调节对比度，确保所有的颜色都能看清。

2. 设定分析范围在 75 bp 和 450 bp 内定尺寸标准峰值中。

3. 再作一张凝胶图像。

4. 用凝胶自动分道器进行分道。

5. 分道结束时，检查各道正确；每个泳道上的数据可提取出来，形成单个样品的文件。从菜单中选择要提取的泳道。

6. GeneScan^®分析软件用两个控制窗口一一分析控制窗和结果控制窗。第一次打开一个项目时分析控制窗出现，用于设定内设尺寸标准和改变分析参数。当样品图像分析完毕时，可选择结果控制窗。该窗控制显示那些结果及其格式。

7. 使用分析控制窗，为每个分析样品生成尺寸标准，峰值如下设定：75、100、140、 150、 160、 200、 250、 300、 400、 450。

8. 安装恰当的母板。

9. 点击带颜色的 B、G、Y 和 R 柱标题，选中所有待分析的泳道。点击分析开始样品分析。已分析的所有样品会在每个网格显示一个小三角。

10. 已分析的样品此时可在结果控制窗中打开，可检査对照的解析梯度峰值和可接受程度。

11. 从此窗口可打印每个样品的 GeneScan^®电子图（EPG）。



12. 这时 Genotyper^®软件可用来为 GeneScan^®中看到的每个峰指定名称。

13. 从一块凝胶获得的所有数据可作为一个 Genotyper^®文件同时处理。

14. 从 GeneScan^®文件中将所有的数据导入 SGM Plus^®的 Genotyper^®模板。

15. 通过按（Apple + 1 ) 标记各峰。

16. 确认每个样品都能正确识別的尺寸标准是很重要的，通过选定红染样品键点击绘图窗口键对指定的名称进行再检查。

17. 等位梯度也应再检査，确保所有代表性等位基因已正确识别。

18. 如果以上都能做到，每个样品的标签可再检查。

19. 还应进行一项检査：所有的峰已正确指定，任何有可能不正确的峰都应通过点击与此标签对应的峰来去掉。

20. 一旦分析员对所指定的名称有信心，可为每个样品打印 Genotyper^®，加到 GeneScan^®EPG 打印件中。

21. 此时可对每个细胞系样品的分析得到的谱与已公开的谱进行比较。