（1）厌氧-好氧生物组合法
上述的两种生物法具有其相应的优点，但单一的处理方法都难以达到国家的排放要求，所以将这两种方法组合后再对废水进行处理。对于浓度为5000～50000 mg/L的柠檬酸废水进行处理，将其混入低浓度的废水中，再进入生物接触氧化池，使用以上方法处理废水使其达到国家排放标准，在一定程度上增加了水资源的利用率，排放的水可以用于农田灌溉、工业用水等。目前，厌氧 -好氧生物组合法已经应用于柠檬酸的废水处理中，图2为其工艺流程。 [13]
（2）厌氧-兼氧-好氧生物组合法
在厌氧 -好氧生物组合处理废水的过程中，好氧单元处理厌氧单元出水运行效果较差的现象，使得废水处理的效率大大降低。基于厌氧单元与好氧单元的相互影响，在两者之间增加生物转化器，将废水进行厌氧处理后，通过转化器增加水中的含氧量，将水中的厌氧物质除去，为好氧单元做好准备，提高好氧单元的处理效率。