罗氏公司近日宣布推出多款SeqCap EZ Library目标富集新产品。SeqCap EZ Library这种方法可在新一代测序之前实现整个外显子组或定制区域的富集。这些新产品旨在加强基础和临床研究中的遗传变异发现和检测,而出色的捕获效率也能将测序费用降至最低。它们经过优化,适用于各种新一代测序平台。
新的定制和固定内容外显子组方案将扩展罗氏现有的外显子组富集产品线。SeqCap EZ Exome Plus Library让研究人员能够在现有的64 MB EZ Exome v3产品上添加高达50 Mb的定制目标,从而创建出自己的目标富集工具,实现总共114 Mb 基因组DNA的靶定和富集。SeqCap EZ Exome +UTR Library则提供了一种扩展的外显子组富集设计,除了现有的64 Mb EZ Exome v3设计,还包括32 Mb非翻译区(UTR),这样总共能靶定96 Mb的外显子和UTR。
SeqCap EZ Library是一种液相捕获方法,可在单管内实现整个外显子组或定制区域的富集。SeqCap EZ Exome v3.0于去年底推出,是过去2.0版本的升级。这一产品可捕获64M的基因组序列,包括所有外显子以及miRNA,它包含与其他NimbleGen液相捕获产品相同的2.1M高密度探针,以确保高效、均一、特异、全面的定向捕获,是市场覆盖面最广的序列捕获产品之一。
同时,罗氏还推出了疾病特异的目标富集panel,适合临床研究应用,让研究人员能够发现与人类癌症和神经系统疾病相关的遗传变异。SeqCap EZ Comprehensive Cancer Design提供了目前最完整的肿瘤学富集设计,覆盖与多种常见和稀有癌症相关的578个基因。SeqCap EZ Neurology Panel Design则覆盖了与87种神经系统疾病相关的256个基因,包括帕金森氏症、阿尔茨海默病、癫痫和自闭症等。
罗氏测序解决方案部门的领导Thomas Schinecker表示:“我们很高兴扩展我们的定向测序产品线,以满足新一代测序领域快速发展的需求。我们在目标富集技术上的行业领先表现为我们提供了一个坚实的基础,为基础研究和转化研究实验室提供这些新的解决方案。此外,我们期待明年初会推出新的SeqCap EZ试剂,为客户带来更多的流程便利。”
罗氏的序列捕获产品一直受到用户的青睐,多次被大型外显子组测序项目选中。不久前,SeqCap EZ Exome产品被加拿大多伦多一医院基因组服务中心选中,用于一个癌症生物标记物研究。今年年初,在英国又被选中用于一个血液病相关研究,对50000个样本进行外显子组捕获。
橡胶树是天然橡胶的主要来源。“橡胶树育种面临的主要困难在于周期长和效率低,通过常规育种方法将多抗、高产性状聚合往往需要30~40年。”中国热带农业科学院橡胶研究所研究员程汉告诉《中国科学报》。然而,目......
记者宋喜群、冯帆从山东农业大学获悉,该校农学院教授孔令让研究团队首次组装了小麦远缘杂交常用物种中间偃麦草和鹅观草染色体水平的高质量基因组序列,解析了二者基因组结构差异与独立多倍化演化路径,对两者携带的......
近日,中国农业科学院烟草研究所烟草功能基因组创新团队发现烟草分枝发育“开关基因”,预示着未来作物株型调控有了新靶点。相关研究成果发表在《植物生物技术》(PlantBiotechnologyJourna......
薇甘菊作为全球十大最具危害的恶性入侵杂草之一,以其惊人的繁殖速度和强大的环境适应性,在亚洲、太平洋地区及中国华南地区造成严重生态破坏。然而,其基因组层面的适应性进化机制长期未被系统解析,制约了科学防控......
近日,中国科学院大连化学物理研究所研究员周雍进团队与上海交通大学副教授鲁洪中合作,在酵母系统生物学研究中取得新进展。研究团队通过整合分析全球1807株酿酒酵母菌株的基因组与生态位数据,构建了高覆盖度的......
近日,中国农业科学院农业基因组研究所农业基因编辑技术创新团队深入解析了中亚野猪种群在跨越欧亚大陆百万年的迁徙历程中适应环境的独特遗传密码,为理解大型哺乳动物如何应对环境变化提供了全新视角。相关研究成果......
人类基因组中超98%的遗传变异位于非编码区,这些变异通过调控染色质可及性、三维构象、剪接加工等多种分子机制影响基因表达,最终导致疾病发生。由于调控机制的复杂性和细胞类型特异性,目前解读非编码变异的分子......
近日,中国科学院生物物理研究所徐涛研究组和何顺民研究组在《基因组、蛋白质组与生物信息学报》杂志发表论文。两位科学家牵头的“女娲”中国人群基因组计划旨在构建中国人群的全基因组数据资源,支撑中国人群的疾病......
中外团队历时10年,在东南亚人群基因组研究领域取得里程碑式突破。北京时间14日晚,“东南亚人群基因组计划”首期成果发表在国际期刊《自然》上,东南亚人群的遗传演化之谜被揭开。论文通讯作者之一、中国科学院......
东南亚是全球最重要的人类演化区域之一。该地区人群拥有极高的遗传多样性,但基因组学研究长期缺失,制约了人类环境适应性进化与疾病遗传机制的深度解析,因而被称为全球人类基因组研究“最后一块拼图”。中国科学院......