胞二磷胆碱（Cytidine Diphosphate Choline，简称CDP-Choline）和咖啡因（Caffeine）在化学结构上存在显著差异。以下是它们之间的主要区别：
化学结构：胞二磷胆碱是一种核苷酸衍生物，由胞嘧啶（Cytidine）、二磷酸（Diphosphate）和胆碱（Choline）组成。而咖啡因是一种生物碱，由一个嘌呤环（由两个氮原子和一个碳原子组成）和一个甲基咖啡因基团组成。
功能：胞二磷胆碱在生物体内主要参与磷脂代谢，是磷脂酰胆碱（一种重要的细胞膜磷脂）合成的前体。磷脂酰胆碱在细胞膜结构、信号传导和神经递质释放等方面具有重要作用。咖啡因则是一种中枢神经系统兴奋剂，通过阻断腺苷受体来提高神经细胞的兴奋性，从而产生提神醒脑、抗疲劳等作用。
应用：胞二磷胆碱主要用于治疗神经退行性疾病（如阿尔茨海默病）和脑损伤等疾病。咖啡因则广泛应用于食品、饮料和药物中，如咖啡、茶、巧克力和某些镇痛药。
毒性：胞二磷胆碱在正常剂量下通常被认为是安全的，但过量使用可能导致一些副作用，如恶心、腹泻和失眠等。咖啡因过量摄入可能导致心悸、失眠、焦虑、胃肠不适等症状。长期大量摄入咖啡因可能对心血管系统产生不良影响。
总之，胞二磷胆碱和咖啡因在化学结构、功能、应用和毒性方面存在显著差异。在使用这些物质时，请遵循医生或药物说明书的建议，以确保安全有效。