常用方法有反转录PCR（RT-PCR）、核酸序列依赖性扩增（NASBANuclisens）、分枝DNA信号放大系统（bDNA）和实时荧光定量PCR扩增（realtimePCR）。病毒载量测定的临床意义包括预测疾病进程、提供开始抗病毒治疗依据、评估治疗效果、指导治疗方案调整以及HIV感染早期诊断的参考指标。小于18月龄的婴幼儿HIV感染诊断可以采用核酸检测方法，以2次核酸检测阳性结果作为诊断的参考依据，18月龄以后再经抗体检测确认。HIV病毒载量检测结果低于检测下限，报告本次实验结果低于检测下限，见于没有感染HIV的个体、接受成功的抗病毒治疗或机体自身可有效抑制病毒复制的部分HIV感染者。HIV病毒载量检测结果高于检测下限，可作为诊断HIV感染的辅助指标，但不能单独用于HIV感染的诊断。推荐病毒载量检测频率：对于已接受抗病毒治疗6个月以上、病毒持续抑制的患者，可每6个月检测1次。HAART6个月内或病毒载量抑制不理想或需调整治疗方案时病毒载量的检测频率需根据患者的具体情况由临床医师决定。如条件允许，建议未治疗的无症状HIV感染者每年检测1次，HAART初始治疗或调整治疗方案前、初治或调整治疗方案初期每4～8周检测1次。病毒载量低于检测下限后，每3～4个月检测1次，对于依从性好、病毒持续抑制达2～3年以上、临床和免疫学状态平稳的患者可每6个月检测1次。