节瓜基因组组装和强雌性状基因挖掘研究获新进展

近日，广东省农业科学院蔬菜研究所瓜类研究一室与中国水稻研究所副研究员鲁宏伟合作，在节瓜基因组组装和强雌性状基因挖掘研究方面取得新进展。相关成果发表于《园艺研究》（Horticulture Research）。

节瓜A36基因组组装。研究团队供图

节瓜属葫芦科冬瓜属冬瓜种，是华南特色蔬菜作物，其营养丰富，风味独特，具有清热、解暑等功效，是重要的功能保健型蔬菜，已成为我国内销和出口的名优特产蔬菜。节瓜以幼嫩果实为主要商品器官，是雌雄异花植物，具有丰富的性别类型。强雌株可以将雌花节率（一般在80%以上）提高到合适比例，除了主蔓底部几节雄花外，后续连续出现的均是雌花，避免畸形瓜等现象，显著提高了节瓜的商品价值。因此，强雌性对与节瓜提早上市、延长采收期、提高种子纯度具有重要意义。

该研究团队利用三代Nanopore sequence、Hi-C和BUSCO技术，组装了高质量的节瓜A36基因组，挂载于12条染色体，基因组全长952.5 Mb，Contig N50为6.9 Mb，Scaffold N50为68.2 Mb，基因组的完整性为96.1%。利用重测序的129份不同节瓜资源的自然群体，开展了强雌性状的GWAS分析，其中CqSg8.1位点位于8号染色体231.6 kb范围内，区间内的BhiCQ0880026447是强雌性状的关键候选基因。

该研究为深入研究该基因调控节瓜强雌性状的分子机制，丰富葫芦科性型调控理论奠定了很好的基础。

上述研究得到国家自然科学基金项目、广东省农业科学院科技创新战略专项资金（高水平农科院建设）项目、广东省农业科学院农业优势产业学科团队建设项目的资助。

相关论文信息：https://doi.org/10.1093/hr/uhae113