芯片有望成为产前诊断的标准方法

　　根据近期发表在《新英格兰医学杂志》上的一篇文章，芯片能够比传统的核型分析提供更多临床上相关的信息，从而有望成为产前诊断的标准方法。

　　这项研究是由哥伦比亚大学医学中心领导的，埃默里大学、Baylor医学院和Signature Genomics也参与了研究工作。他们的主要目标是与传统的核型分析相比较，评估芯片分析的准确性、有效性和潜在优势。他们的次要目标是评估分析性能。自上世纪70年代起，核型分析就成为了产前诊断的标准方法。

　　在四年的时间里，研究人员利用Affymetrix和安捷伦制造的芯片以及核型分析，对4,400名患者开展了试验。他们从高龄产妇中收集了羊水，并对胎儿进行早期筛查，了解唐氏综合征的风险是否升高，并通过超声波检查结构异常，以及其他问题。所有样品被送到一个参考实验室，开展染色体分析。所有数据提交到NCBI，对公众免费开放。

　　研究人员发现，基于芯片的分析与核型分析一样，能够识别常见的非整倍体(即染色体数目异常)，这会导致唐氏综合征(21三体)和爱德华兹综合征(18三体)等疾病。此外，对于超声波检查到生长或结构异常的胎儿，芯片能够在6%的病例中检测到临床相关的染色体缺失或重复，而核型分析并未检测到。另外，对于高龄产妇或筛查结果呈阳性的病例，芯片技术能够发现1.7%的异常(即每60个孕妇中的1个)，而她们有着正常的核型。

　　根据这些结果，第一作者Ronald Wapner认为，芯片将取代核型分析，成为评估胎儿染色体异常的标准方法，并认为芯片所发现的染色体微缺失和微扩增也常常伴随着严重的临床问题。Wapner是哥伦比亚大学医学中心妇产科的教授。

　　据安捷伦公司介绍，该公司的芯片和试剂在研究中发挥了重要作用。71%的样品是在安捷伦的SurePrint CGH芯片上运行的，而数据分析时也用了安捷伦的软件。安捷伦还协助研究人员开发了定制芯片。研究总共使用了5,500块芯片。

　　目前，芯片分析所使用的样品需要通过侵入手段获得胎儿细胞，如羊水穿刺或绒毛取样。Wapner认为，一旦有了非侵入性方法来检测胎儿的遗传性异常，所有孕妇都应该进行芯片分析，而不只是那些高风险孕妇。

　　Wapner也在文中提到，随着胎儿的全基因组测序在临床上变得可行，从芯片分析中吸取的经验教训也会有所帮助，将有助于确保新技术的合理应用。目前一些公司已经推出了基于测序的检测，来实现非整倍体的非侵入性产前诊断，包括Sequenom、Ariosa Diagnostics和Verinata Health。

　　美国医学遗传学协会在两年前更新了其指引，建议将芯片作为第一轮产后评估检测，来诊断那些患有发育迟缓或智力障碍、自闭症或多种先天性异常的患者。然而，在产前背景下，该机构仍然认为芯片应当作为核型分析的辅助检测。

　　尽管如此，目前有多家机构和公司提供基于芯片的产前检测。Baylor医学院于2004年最先在美国推出基于芯片的产前检测，而Signature Genomics(如今属于PerkinElmer)和CombiMatrix也在近几年推出类似的服务。