发布时间:2011-03-31 17:01 原文链接: 英国牛津大学MattiasRantalainen博士访问武汉物数所

  3月29日,应中科院武汉物理与数学研究所生物波谱及代谢组学研究组唐惠儒研究员和王玉兰研究员之邀,英国牛津大学Mattias Rantalainen博士到该所进行学术交流,并作了题为Predictive Multivariate Latent Variable Models for Biomarker Discovery in 1H NMR-based Metabonomics 的学术报告。

  报告中,Mattias Rantalainen博士详细介绍了在代谢组学数据挖掘的过程中,如何利用多变量模式识别方法来合理地、有效地解释核磁谱图数据,从而发现可能的潜在生物标记物,而有效的建模方法是构建合理预测模型的关键。同时,针对当前常用的多变量模型预测方法只适用于线性关系这一缺点,他提出了一种基于核(kernel)技术的K-OPLS(K-正交化偏最小二乘法分析)方法,引入kernel函数能有效改变自变量与因变量之间的关系,大大提高了该建模方法的非线性处理能力。

  Mattias Rantalainen博士在所访问期间,与生物波谱及代谢组学组的研究人员及学生进行了广泛的交流,并参观了波谱实验室,对代谢组学研究方向表示出极大的兴趣,并且表达了日后进行深入合作的愿望。

  Mattias Rantalainen博士刚荣获牛津大学统计学系的医学研究理事会(MRC)生物信息学的奖学金(2009-2012)。他本科毕业于瑞士于默奥大学(Umeå University)的生物工程专业。之后在英国帝国理工学院Elaine Holmes和Jeremy Nicholson教授的实验室攻读博士学位,期间他发展了一种应用于代谢组学的新的多变量模式识别方法。毕业后加入牛津大学统计学系Prof Chris Holmes课题组从事博士后研究,进行数据分析方面的工作。

相关文章

将领域知识引入神经网络,MIT团队用光谱Transformer研究非靶向代谢组学图谱

代谢组学研究已经确定了介导细胞信号传导、竞争和疾病病理学的小分子,部分原因是大规模社区努力测量数千种代谢物标准品的串联质谱。然而,在临床样品中观察到的大多数光谱不能与已知结构明确匹配。令人惊讶的是,用......

中药基础物质、代谢及代谢组学研究方案

中药组成成分复杂、作用环节多样,中药药效物质基础以及临床疗效机理的阐明,已成为中医药现代化研究的重要内容。如何快速地从海量的质谱数据中获取有价值的信息,减轻繁重的数据处理工作量,成为广大中医药研究工作......

研究发现提高鲜食玉米耐热性基因

近日,广东省科学院南繁种业研究所玉米种业室团队以甜玉米为研究对象,对甜玉米高温下的表型特征变化进行观察,发现了提高鲜食玉米耐热性基因。相关研究论文发表于InternationalJournalofMo......

大咖面对面丨代谢组学前景广阔质谱构建核心平台

临床质谱近年来发展迅猛,许多诊断标志物都是小分子代谢物,表明代谢组学从研究到临床转化的路径更快;与此同时,代谢组学近年来在生命医学、植物学、暴露组学等研究中发挥了越来越重要的作用,几乎每一项多组学研究......

强强联手,合作双赢“全景和空间代谢组学新技术”研讨会

强强联手,合作双赢——中国科学院大连化学物理研究所与岛津共同举办“全景和空间代谢组学新技术”研讨会代谢组学作为系统生物学的重要组成部分,已渗透到众多研究领域,并广泛应用于疾病诊断、个性化医疗、药物研发......

2023“代谢组学与生命健康:机遇和挑战”研讨会

由中国科学院大连化学物理研究所主办的2023“代谢组学与生命健康:机遇和挑战”研讨会于2023年5月18-20日在大连召开。代谢组学是对分子量小于1500的内源性代谢物研究的科学,在生命健康、医药研发......

“代谢组学与生命健康:机遇和挑战”研讨会

......

会议通知|第二届紫荆代谢组学国际会议(第二轮通知)

第二届紫荆代谢组国际会议将于2023年5月13日-14日在北京召开。......

4套高端质谱仪预算3670万?清华斥巨资加强蛋白组学建设

近日,清华大学发布了招标公告,计划以3670万元预算购置4套高端质谱,用于蛋白组学与代谢组学分析。招标公告详情如下:一、项目基本情况项目编号:BIECC-22ZB1106/清设招第2022732号项目......

再帕尔·阿不力孜最新成果:建立质谱成像可视化新方法

中国医学科学院&北京协和医学院药物研究所“天然药物活性物质与功能”国家重点实验室再帕尔•阿不力孜研究员团队,在《药学学报》英文刊(ActaPharmaceuticaSinicaB)发表了题为“......