1.直接法：
用特异荧光抗体直接滴加于标本上，使之与抗原发生特异性结合。
本法操作简便，特异性高，非特异荧光染色因素少;缺点是敏感度偏低，且每检查一种抗原需制备相应的特异荧光抗体。
2.间接法：
可用于检测抗原和抗体。
本法有两种抗体相继作用，第一抗体为针对抗原的特异抗体，第二抗体(荧光抗体)为针对第一抗体的抗抗体。
本法灵敏度高，而且在不同抗原的检测中只需应用一种荧光抗体。
3.双标记法：
本法用FITC及罗丹明分别标记不同的抗体，而对同一标本作荧光染色。
在有两种相应抗原存在时，可同时见到橙红和黄绿两种颜色荧光。