肛瘘有间歇期和发作期。间歇期会完全没有症状，这时可以不用药。发作期出现流脓、红肿、疼痛等症状，如果不能马上手术，也可以采取药物治疗暂时缓解症状。
（1）外治 用消肿止痛洗剂坐浴，外涂金黄膏。
（2）使用抗生素 急性发作期可以使用抗生素，但一般不要超过一周。
（3）中药内服 用萆薢渗湿汤加化毒除湿汤加减，伴发热用仙方活命饮。
