对于维生素缺乏所致的高同型半胱氨酸血症患者， 目前临床中多联合使用维生素B6、维生素B12和叶酸进行治疗。
1、叶酸
对于单纯高同型半胱氨酸血症可补充叶酸治疗，若合并高血压，可以使用依那普利叶酸片降压治疗。
2、维生素B6和维生素B12
单独使用维生素B6和维生素B12降低血浆同型半胱氨酸的作用并不明显， 只有同时应用叶酸时才能显著降低血浆同型半胱氨酸水平。
注意事项：研究结果提示，补充B族维生素可能更适用于由于饮食及不良习惯导致的高同型半胱氨酸血症，对于遗传因素引起的高同型半胱氨酸血症效果不如前者明显。另外，大剂量应用叶酸可能会导致哮喘、皮疹等，加大罹患前列腺癌的风险。所以应在医生的指导下根据体内维生素水平进行个体化治疗。