根据临床表现，病史及实验室检查可做出诊断。急性过敏性间质性肾炎的临床诊断标准至今尚未统一，较为公认的有：
1.用药史
近期有过敏性药物用药史。
2.全身变态反应
NSAID类药导致的ATIN不常见；尿液中的嗜酸性粒细胞增高是过敏性间质性肾炎诊断的重要线索，但阳性率往往不高，尿液碱化有助于发现嗜酸性粒细胞，两侧或单侧肋腰部疼痛并不常见，这可能是由于肾脏弥漫性肿大牵拉肾包膜所致；在炎症细胞浸润的间质性肾炎中，放射性枸橼酸镓显像常为阳性，尤其在疾病的早期阶段，这个检查显得更有意义。
3.尿检查异常
无菌性白细胞尿（包括嗜酸性粒细胞尿）可伴白细胞管型，镜下血尿或肉眼血尿，轻度至重度蛋白尿（常为轻度蛋白尿，但非类固醇抗炎药引起者蛋白尿可达重度）。
4.在短期内出现进行性肾功能减退
近端和（或）远端肾小管功能部分损伤及肾小球功能损害。
B超示双肾大小正常或偏大，凡具备以上1，2及3和（或）4者，临床诊断可以成立，但是，非典型病例（尤其是由非甾体抗炎药致病者）常无2，必须依靠肾活检病理检查确诊，肾活检见病理改变为双侧肾脏弥漫性病变，肾间质弥漫或多灶性的炎症细胞浸润，导致的间质水肿，肾小管有不同程度的退行性改变乃至坏死；肾小球多正常，部分患者可见免疫球蛋白IgG和补体C3的沉积，或血中可测得抗TBM抗体。