质粒是携带外源基因进入细菌中扩增或表达的主要载体,它在基因操作中具有重要作用。质粒的分离与提取是最常用、最基本的实验技术。质粒的提取方法很多,大多包括3个主要步骤:细菌的培养、细菌的收集和裂解、质粒DNA的分离和纯化。本实验以碱裂解法为例,介绍质粒的抽提过程。
在pH 12.0 ~ 12.6碱性环境中,细菌的线性大分子量染色体DNA变性分开,而共价闭环的质粒DNA虽然变性但仍处于拓扑缠绕状态。将pH调至中性并有高盐存在及低温的条件下,大部分染色体DNA、大分子量的RNA和蛋白质在去污剂SDS的作用下形成沉淀,而质粒DNA仍然为可溶状态。通过离心,可除去大部分细胞碎片、染色体DNA、RNA及蛋白质,质粒DNA尚在上清中,然后用酚、氯仿抽提进一步纯化质粒DNA。
pUC18大肠杆菌
LA培养基异丙醇水乙醇
无菌牙签移液枪震荡器Eppendorf管离心机超净台
1. 取含有pUC18质粒的大肠杆菌菌液于LA培养基上37 ℃过夜培养;2. 用无菌牙签挑取单菌落,接种于含有Amp抗生素的LB培养基中,37 ℃摇床~250 r/min过夜培养;3. 吸取1.5 ml菌液,12000 g离心2分钟,收集菌体,倒掉菌液;吸取1.5 ml菌液,再次收集菌体,尽量将菌液倒干净;4. 溶液m4. 加入300 μI振荡打匀,重新悬浮细胞,震荡混匀(注意:应彻底打匀沉淀或碎块); 5. 加入300 μI溶液II,轻柔颠倒混匀,放置至清亮,一般不超过5分钟;6. 加入300 μI溶液III颠倒混匀,放置于冰上10分钟,使杂质充分沉淀;7. 12000 g离心10分钟;8. 吸取800 μI上清液(注意:不要吸取到飘浮的杂质)至另一Eppendorf管中,加入2/3体积的异丙醇,室温下放置5分钟;9. 12000 g 常温离心15分钟;10. 倒尽上清,加75%乙醇浸洗除盐(放置片刻或离心3分钟后倒去上清);11. 室温放置或超净台上风干DNA;12. 加40 μI灭菌超纯水或TE溶解;13. 质粒、BAC的质量检测,于-20 ℃保存。
1.溶液工与溶菌液充分摇匀,用力适当。因为此时细菌还没有与碱和SDS作用,染色体DNA尚未释放,不必担心其分子断裂,一般可用力振荡几次。
2.加入SDS后则要注意不能过分用力振荡,温和混匀,但又必须让它反应充分。
3.加入溶液Ⅱ混匀之后,一定要在冰上放置,不要摇动,对于溶液Ⅲ同样处理。
4.干燥DNA时应采用室温自然使乙醇挥发来干燥DNA,不使其过度失水,保持湿润状态。
来源《微生物学实验》