质粒DNA的转化和染色体DNA的转化有显著的不同。
在一般情况下前者的转化效率远远低于后者。
但如果先用一定浓度的钙离子处理大肠杆菌细胞，再用质粒DNA和染色体DNA对它做转化实验则情况恰好相反。此外，质粒DNA很容易进入去掉了细胞壁的细菌的原生质体，说明对它的吸收并不通过专门的接受位点；
质粒DNA的转化过程没有整合这一环节。
