四级杆分析器工作方式主要有三种：
全离子通过(TTI)、扫描(SCAN)、选择离子监测(SIM)。
将两个四级杆在空间上串联起来，主要的工作方式有全扫描(Scan)，选择离子监测(SIM)，子离子扫 描(Product Ion Scan)，母离子扫 描 (Precur—sor Ion Scan)，多重反应监测(MRM)。
