质谱流式的同位素是原子还是离子

晚上好，这是不可以的，你把概念搞混了。
同位素是针对原子的，指的是相同质子数，不同中子数的原子之间互称同位素。
而离子说的是原子或原子团失去或获得电子的事情，两者是不相关的。
当然，即使构成氧原子和氧离子的原子钟含有的中子数目不同，也不能互称同位素。