赛默飞世尔科技公司近日宣布,适用于癌症研究的靶向检测产品线又增添四款新产品,包括Oncomine Immune Response Research Assay,它能够拷问肿瘤微环境,并鉴定免疫治疗临床试验中的预测性标志物。这一系列产品适用于Ion Torrent NGS平台,与FFPE样品兼容。
目前,各大制药公司都在争相开发新药,以激活身体的免疫系列来对抗癌症。这是因为某些癌症类型的生存率低,或因耐药性存在,可选择的治疗方案十分有限。研究表明,靶向化合物和免疫治疗的组合能够延长存活时间,不过目前缺乏有效的工具来准确测定关键基因的表达。
OmniSeq LLC的首席科学家Carl Morrison博士解释说,低表达的基因在调控免疫系统中发挥关键作用。“虽然有数百个免疫治疗试验正在进行中,但许多都没有纳入关键的生物标志物,对肿瘤样品进行分层。这些NGS方案有助于更有效地阐释相关变异的表达,”他说。
Oncomine Immune Response Research Assay是一个395个基因的集合,它利用靶向NGS的力量来鉴定免疫系统中关键基因的表达,且只需要10 ng FFPE RNA。利用自动化的Ion Chef和Ion S5系统,每次运行可以对4个、8个或32个样品进行多重检测,实现经济高效的分析。
与转录组分析相比,Oncomine Immune Response Research Assay的检测灵敏度有20倍的改善。它能够高度重复地检测低表达的细胞因子编码基因,也能够高度特异地检测低至两倍的差异表达。
同期推出的还有Oncomine BRCA Research Assay、Oncomine Breast cfDNA Assay和Oncomine Colon cfDNA Assay。它们都属于端对端流程中的一部分,这个流程还包括利用Ion Torrent测序仪开展测序,以及利用经过优化的生物信息学软件进行分析和报告。
Oncomine BRCA Research Assay可全面分析BRCA 1和2基因,了解FFPE组织中的体细胞和生殖系突变。它基于Ion AmpliSeq技术,覆盖度达100%,包括侧翼的内含子序列。此检测在困难FFPE组织上的表现已经过22个实验室的评估。
Oncomine Breast cfDNA Assay和Oncomine Colon cfDNA Assay可检测游离DNA中低至1%的驱动突变和耐药突变。这些检测由OncoNetwork联盟开发,可以灵敏且特异地检测SNV热点和插入缺失,适合当下热门的液体活检应用。
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