蛋白质合成：转肽反应是蛋白质合成过程中的关键步骤之一。在细胞质中，核糖体通过转肽反应将氨基酸连接起来，形成多肽链。这些多肽链进一步折叠和修饰后，形成具有特定结构和功能的蛋白质分子。
细胞壁合成：在细菌中，转肽反应是细胞壁合成过程中的关键步骤之一。通过转肽反应，多肽链被连接到细菌细胞壁的聚糖骨架上，从而形成一个完整的细胞壁结构。这对于细菌的生长和繁殖至关重要。
凝血作用：在血液凝固过程中，转肽酶催化纤维蛋白原转化为纤维蛋白，从而形成血栓。这个过程被称为纤维蛋白聚合反应(fibrin polymerization)，是血液凝固的关键步骤之一。