过碳酸钠晶体有正交结构，有Cmca空间群。降温到零下30度以下，结构会转变为Pbca。
过碳酸钠溶于水可以生成过氧化氢、钠离子和碳酸根，过氧化氢继而分解产生水和氧气：
2Na2CO3⋅3H2O2⟶3H2O2+4Na++2CO32−
2H2O2⟶2H2O+O2
