生命在于运动。不仅我们人类需要每天通过运动来增强体质,我们体内所有的生物大分子也无时无刻不以运动来维持生命的运转。
在生物体内,分子的运动速度是用扩散速率来表征。它能提供例如细胞活性,反应速率以及大分子相互作用等重要信息。
长期以来,活细胞内生物大分子的扩散速率通常使用经典光学方法例如荧光相关光谱(fluorescence correlation spectroscopy),光漂白后荧光恢复(fluorescence recovery after photobleaching)以及单分子追踪(single-molecule tracking)技术。
但这些技术的共同缺点是不能提供很好的空间分布,而且很难监测到那些速率极快的分子(>20 μm2/s)。因此,发展一种全新的具有高空间分辨率的扩散速率测定技术成为目前的一项难题。
2020年3月17日,美国加州大学伯克利分校Ke Xu教授科研团队在Nature Methods上发表了题为 “Single-molecule displacement mapping unveilsnanoscale heterogeneities in intracellulardiffusivity” 的文章,开发了活细胞内具有高分辨率的扩散速率成像技术,并将它命名为SMdM技术。博士后向立民,陈琨为该论文的共同第一作者。
该项技术借助频闪技术,通过缩短相邻两个激光脉冲(分别处于相机的两帧)的时间距离到1 ms,从而克服了EM-CCD相机在宽场成像范围下只有110 Hz(~9 ms)成像频率的问题。
这样,即使对于很快的运动分子(>20 μm2/s),它们也只运动了1 ms的时间,从而依然能借助单分子追踪技术跟踪到它们,而不用担心其运动时间过长(例如9 ms)导致离焦等问题。
运用该技术,作者成功的实现了活细胞内自由扩散的荧光蛋白分子的扩散速率的成像,并得到一张像素点为100 nm2的分布图(图左)。
这张图清晰的展示了活细胞内生物分子的扩散速率是不均匀的。有的地方快,有的地方慢,而这些慢的区域往往会连成一条线。
运用超分辨荧光显微镜技术,作者进一步发现这些慢的区域是由于该处密集的细胞骨架蛋白(actin)造成的(图右)。这些细胞骨架蛋白犹如伞的骨架一样,用于撑开整个细胞的体积,保持细胞的形状。
但令人惊讶的是,在保持细胞形状的同时,过密的细胞骨架蛋白会导致区域内扩散速率的降低。这就像交通状况一样,车辆增多,道路拥挤,车速自然就要下降。
作者进一步发现,活细胞的细胞核内扩散速率同样呈现不均匀性。除开核仁内部十分拥挤,扩散速率极低之外,核质部分的扩散速率受染色质DNA分布的影响。类似于骨架蛋白在细胞质中的影响,染色质DNA在细胞核内同样会阻碍蛋白质分子的扩散。
最后,作者发现通过改变荧光蛋白分子的电荷数,能达到改变其 在细胞内扩散速率的作用。但出乎意料的是,只有正电荷能让细胞内扩散速率降低,负电荷却无法改变扩散速率。
至此,作者提出了一个可能的猜想。细胞内生物大分子的电荷分布是不均匀的,大部分生物大分子(DNA,RNA和部分蛋白质)均带有强烈的负电荷。
这些负电荷的大分子只会严重阻碍外来的正电荷大分子的运动。不过,这项发现背后真正的原因还有待进一步的实验证实。
总之,这项工作提供了一种全新的高空间分辨率的活细胞内扩散速率成像技术,揭示了胞内扩散速率的不均匀性,同时发现了正电荷和负电荷对扩散速率的不同影响。
该技术有望成为活细胞内分子运动及相互作用的重要研究工具,从而进一步揭示细胞层面的分子机制以及开发药物作用成像平台。
美国加州大学戴维斯分校一项新研究揭示,压力不仅影响大脑,还会在分子层面改变心脏功能。相关论文发表于最新一期《分子与细胞心脏病学杂志》。图片来源:物理学家组织网这项研究聚焦于环境与社会压力因素,如噪音、......
化合物结构测定能够帮助人们认识、利用和改进药物和天然产物中的有效成分。由浙江大学、美国得克萨斯大学奥斯汀分校及浙江师范大学、南京大学学者组成的联合研究团队提出“超分子对接”概念,利用“分子捕手”,特异......
美国能源部劳伦斯伯克利国家实验室科学家领导的团队首次发现一种含有锫(Berkelium)的有机金属分子——“锫茂”(Berkelocene),为深入理解物质构成的基本原则开辟了新途径。相关研究论文发表......
图(a-c)可级联响应肿瘤微环境的分子组装探针及其研究示意图;(d,e)小鼠模型上原位胰腺癌的荧光成像与信号强度变化在国家自然科学基金项目(批准号:22274074、2137003)等资助下,南京大学......
近日,中国科学院青岛生物能源与过程研究所的科研团队研发出一种新型材料——ZMQ-1分子筛,解决了传统材料无法处理“大分子”的难题,在促进化工生产更加绿色、高效等方面有广阔应用前景。该成果北京时间12月......
——探索生命奥秘新途径为促进我国糖复合物领域的合作交流,加快国内糖科学的发展 ,由中国生物化学与分子生物学会糖复合物专业分会、复旦大学/卫健委糖复合物重点实验室主办 ,分析测试百科......
近日,电子科技大学光电科学与工程学院教授郑永豪团队在《科学进展》在线发表了最新科研进展。这项研究创新性地提出了“off-siteradicalsinjection”的概念,利用先进的单分子结技术,实现......
探索无机成分以外的玻璃是人造透明材料发展的新方向,受聚合物和超分子玻璃的启发,科研人员探索通过低分子量单体的聚合制备透明玻璃。中国农业科学院麻类研究所可降解材料开发与利用创新团队联合有关单位,构建了一......
运动有益健康,但人们并非总是想去锻炼,这究竟受到什么影响?西班牙国家癌症研究中心萨比奥研究团队发现了与身体运动有关的3种蛋白质,这些蛋白质可能是激活运动欲望的“开关”。相关论文发表在最新一期《科学进展......
科技日报讯(记者刘霞)据英国《自然》杂志网站日前报道,美国特拉华大学的工程师开发出一种化学处理工艺,能高效地将织物分解为可循环再利用的分子。研究人员指出,如果扩大规模,该技术有望显著缓解时尚行业面临的......