通过qPCR开展基因表达谱分析

　　一提起基因表达谱分析，大家马上会想到芯片。然而，并不是每个实验室都具备这个条件。现在，利用每个实验室都有的定量PCR仪，也能开展可靠的基因表达谱分析啦。

　　QIAGEN推出的RT2 Profiler PCR Array是一种高度可靠且灵敏的基因表达谱分析技术，它利用实时定量PCR分析信号转导、生物过程或疾病研究通路中聚焦的一组基因。

　　目录上的每个RT2 Profiler PCR Array都包含一列通路聚焦的基因以及5个看家(参考)基因。此外，每个阵列还包含一组ZL的对照，以监控基因组DNA污染(GDC)以及第一链合成(RTC)和实时定量PCR的效率(PPC)。

　　为什么要使用RT2 Profiler PCR Array?

　　- 简约：RT2 Profiler PCR Array的简约让常规的表达谱分析可在任何科研实验室的实时定量PCR仪上实现。

　　- 性能：RT2 Profiler PCR Array具有灵敏度、重复性、特异性和可靠性，可准确地以96和384孔板、100孔盘管和96x96芯片形式同时分析多个基因。

　　- 关联：RT2 Profiler PCR Array着重分析对您的研究很重要的通路或疾病状态相关的基因。

图1. RT2 Profiler PCR Array中的每孔测定了与通路或疾病状态相关的基因的表达。

图2. Common Cytokine RT2 Profiler PCR Array鉴定出PBMC刺激后23个上调的基因和6个下调的基因。

　　RT2 Profiler PCR Array系统如何工作

　　RT2 Profiler PCR Array是一个完整的系统，适用于通路聚焦的基因表达分析。从样品制备到数据分析，RT2 Profiler PCR Array系统包含了四个组分，可保证高质量、重复可靠的基因表达数据。

　　作为RT2 Profiler PCR Array系统性能中不可缺少的一部分，一组ZL的对照元素可增强数据的可靠性，且随着时间的推移，可充当性能的保证。这些元素让研究人员能够确定样品是否被基因组DNA(gDNA)所污染，逆转录反应的质量和实时定量PCR的效率，从而快速评估数据的质量。RT2 Profiler PCR Array系统中的每个组分都融入了一个联锁系统(interlocked system)，有助于这些质量对照元素，以便全面监控过程中的每一步。

　　1. RT2 Profiler PCR Array

　　每个通路聚焦的RT2 Profiler PCR Array都包含89个实验室验证过的RT2 qPCR Primer Assay(包括5个看家基因)和1个ZL的对照板。

　　2. RT2 SYBR Green qPCR Mastermixes

　　随引物设计算法而演化的缓冲液独特配方带来了高的扩增效率。目前有参考染料可供选择(ROX、荧光素或不含)。

　　3. RT2 First Strand Kit

　　RT2 Profiler PCR Array所检测的外部RNA对照检验了起始RNA的质量。它还特有一款ZL的基因组DNA去除缓冲液，这对去除残留gDNA、确保mRNA的特异检测很关键。

　　4. 免费的数据分析软件

　　RT2 Profiler PCR Array 在大的检测范围内评估一组通路聚焦的基因表达的能力产生了大量的数据。有了我们免费的RT2 Profiler PCR Array数据分析工具，原始CT值到倍数变化的结果都能在几分钟内以各种形式(散点图、火山图、聚类图)表现。