MSC可通过旁分泌或细胞间接触发挥免疫调节作用，且其免疫调节具有很强的可塑性，可以说具有双向调节作用：根据局部微环境刺激因子的种类和数量不同，MSC可作出不同的反应。例如，在大量促炎因子(如IFN-γ，TNF-α等)刺激下，MSCs被激活转变为抗炎MSC2型，产生大量的NO/IDO等免疫调节因子以及趋化因子，抑制效应性T细胞的功能，上调调节性T细胞(Treg)。
