1、搞好环境卫生，加强厕所及粪便管理，消灭苍蝇孳生地，发动群众消灭苍蝇。
2、加强饮食卫生及水源管理，尤其对个体及饮食摊贩做好卫生监督检查工作。
3、对集体单位及托幼机构的炊事员、保育员应定期检查大便，做细菌培养。
4、加强卫生教育，人人做到饭前便后洗手，不引生水，不吃变质和腐烂食物，不吃被苍蝇沾过的食物。
5、不要暴饮暴食，以免胃肠道抵抗力降低。
6、做好消毒隔离工作，食具要煮沸15分钟消毒，病人的粪便要用1%漂白粉液浸泡后再到入下水道。
7、保护易感人群，近年来使用志贺菌依链株减毒活菌苗口服，可产生IgA，以防止痢菌菌毛贴附于肠上皮细胞，从而防止其侵袭和肠毒素的致泻作用。
也有学者采用X线照射及氯霉素或亚硝胍诱变等不同方式获得减毒变异株，用于主动免疫，已获初步效果。但总的来说，由于痢疾杆菌的亚型比较多，因此，制成特异性的疫苗难度较大。另外，病愈后机体产生的特异性免疫持续时间也不长，因此，最重要的预防措施还是切断传播途径。