一、实验室检查：血清学试验：用放免分析及酶联免疫吸附试验测定血清中甘露聚糖抗原可得40%～50%的敏感性。在非侵入念珠菌感染中则见不到甘露聚糖抗原。
二、其他辅助检查：
1.X 线检查 食管运动功能减低，食物潴留，节段性狭窄、痉挛性溃疡，但严重感染时，X 线所见亦可显示正常。
2.内镜检查 是最敏感和特异的诊断方法。内镜下特征性的表现为食管黏膜附着豆渣样白苔，去苔后食管黏膜有充血性红斑，脆性增加，有糜烂、浅溃疡等改变。因炎症的程度不同，病变的范围和严重程度不同。轻者仅表现为食管散在点状白苔，苔下黏膜轻微发红，多见于食管的上中段。重者白苔呈大片状甚至融合成全周，苔厚，去苔后黏膜呈糜烂、溃疡，多伴有出血，多见于食管的中下段。
Kodsi 等(1976)对内镜下念珠菌性食管炎表现分为4 级。
1 级：少数隆起白斑，直径＜2mm，伴有充血，无糜烂、溃疡。
2 级：多个隆起白斑，直径＞2mm，伴有充血，无糜烂、溃疡。
3 级：白苔融合成线状或出现结节状隆起斑块，伴有糜烂、溃疡。
4 级：3 级表现加上黏膜脆，伴有管腔狭窄。