1月22日,国家基因组科学数据中心正式发布2019新型冠状病毒资源库。该库整合了世界卫生组织(WHO)、中国疾病预防控制中心(CDC)、美国国家生物技术信息中心(NCBI)、全球流感序列数据库(GISAID)等机构公开发布的冠状病毒基因组序列数据、元信息、学术文献、新闻动态、科普文章。同时,对不同冠状病毒株的基因组序列做了变异分析与展示。
2019新型冠状病毒资源库收录了来源于NCBI的GenBank数据库和GISAID数据库发布的2019新型冠状病毒(2019-nCoV)病毒株的株名、采样日期、采样地点、样本提供单位、数据递交单位等元信息。通过该资源库还可访问到国家基因组科学数据中心基因组数据库GWH从公共数据库收录的冠状病毒科基因组和蛋白序列,用户可基于Accession号、种名、属名、采样日期、采样地点、宿主、分离源、发布日期等元信息筛选感兴趣的冠状病毒株,个性化选取序列进行下载以开展相关的科学研究。
2019新型冠状病毒资源库将持续更新元信息与基因组序列数据,实时监控NCBI的PubMed数据库中发表的2019新型冠状病毒和其他冠状病毒的学术文献、中新网与新华网发布的新闻,同步更新世界卫生组织与中国疾病预防控制中心发布的科普介绍,为用户开展学术研究、掌握科研进展、了解新闻动态与科学知识提供资源与窗口。
2019新型冠状病毒资源库基于不同参考基因组序列开展2019-nCoV病毒株基因组变异分析,并对结果进行了统计与可视化展示。通过对全基因组序列相似性比较和变异位点分析,获取2019-nCoV病毒株之间、2019-nCoV病毒株与SARS冠状病毒以及与类SARS冠状病毒蝙蝠株之间的变异程度、变异区域、变异碱基的详细信息。经数据分析,2019-nCoV与2003年爆发的SARS病毒基因组序列相似度为80%,与2017年2月从国内的蝙蝠中采集到的Bat SARS-like coronavirus isolate bat-SL-CoVZC45基因组序列相似性最高,相似度为88%。对2019-nCoV病毒株的基因组变异分析为追溯病毒来源、追踪病毒株变异路径、防控新型冠状病毒引发的疫情、治疗病毒性肺炎提供重要的数据基础与决策支持。

2019新型冠状病毒基因组序列发布动态

GWH数据库收录的冠状病毒科基因组序列信息

2019新型冠状病毒基因组变异分析:基因组变异分析的参考基因组为GenBank发布的2019新型冠状病毒株基因组序列MN908947.3,SARS-Cov为SARS 冠状病毒,bat-SL-CoVZC45为类SARS冠状病毒蝙蝠株,其余基因组序列来源于GISAID发布的2019新型冠状病毒株。红色竖线表示变异位点。
近段时间,新冠病毒感染出现一个“小高峰”,中国疾控中心发布数据显示,5月初门急诊流感样病例中,新冠病毒阳性样本占16.2%,与4月初7.5%的比例相比,呈现翻倍式增长。知名艺人也因感染新冠病毒将演唱会......
“本轮新冠疫情自3月份开始,已持续近3个月,属于一次正常的波动。”首都医科大学附属北京佑安医院感染综合科主任医师李侗曾向记者表示,从近几年情况看,新冠疫情一般半年到一年会有一个流行高峰,预计此波疫情将......
2025年4月30日,国家卫生健康委有关负责人就《关于新冠疫情防控与病毒溯源的中方行动和立场》白皮书发布答记者问时指出,大量研究表明,新冠病毒起源于中国境外,下一步的溯源工作应重点在美国开展。美国早期......
近日,世界卫生组织(WHO)发出警告,新冠病毒感染正在全球范围内激增,并且这种情况不太可能很快得到改善。不仅如此,近期我国新冠病毒感染率也有所上升,中国疾控中心8月8日公布的7月全国新型冠状病毒感染疫......
“以为是空调吹多了或者上火了,没想到是又一次新冠感染”;“大三伏天的居然又‘阳’了”;“除了没有连续高烧,喉咙痛、鼻塞、咳嗽等症状又经历了一遍”。近期,社交媒体平台上不少人表示自己“阳了”,出现发烧、......
近日,中国科学院广州生物医药与健康研究院研究员熊晓犁团队与广州医科大学附属第一医院、广州国家实验室等单位合作,在国家自然科学基金等项目的大力支持下,揭示了非典型VH1-2抗体耐受新冠病毒刺突蛋白突变的......
该所研究员赖仞团队近期联合中国医学科学院医学生物学研究所彭小忠和廖国阳团队以及四川大学赵旭东团队,共同揭示了转铁蛋白受体是另一种通过直接与病毒刺突蛋白高亲和力结合而介导新冠病毒进入的受体。《美国科学院......
为加快高校和科研机构专利转化运用,浙江专利转化资源库正式上线,筛选了首批1365件重点推广专利,推送至该省152个产业专利池,并联动“浙江企业在线”数字化应用,通过数据分析匹配推送至有潜在需求的678......
2023年12月20日,中国科学院生物物理研究所薛愿超课题组、中国医学科学院北京协和医学院王健伟课题组及中国科学院武汉病毒研究所周溪课题组合作在《MolecularCell》杂志在线发表了题为&quo......
近期,一种名为JN.1的新冠变异株正在全球快速蔓延,并已在12个国家被发现。据英国和美国卫生机构声称,该变异株是当前已知的增长最快的新冠变异株,预计可能引发新一轮新冠感染浪潮。传播最快新冠变异株来袭当......