BCR断裂点的异质性，决定了BCR/ABL产物的分子异质性。98%CML的BCR断裂点在ber(bcr﹣)，主要在BCR14附近3kb区域内。由此形成的BCR/ABL，表达8.5kbmRNA蛋白。5.8kb bcr区域是BCR基因的一部分，包括12、13、14和15号4个外元及相应的内元。
绝大多数断裂点位于14号外元上游，则 BCR-ABL融合基因包含BCR1~13号外元；如断裂点位于14号外元下游，则14号外元也包含在融合基因中。在很少情况下15号外元也包含在内(5区)由于转录后mRNA的剪接作用虽然融合基因有14号外元，但最终表达产物也可能丢失它。