4月21日,Cell发表了一篇关于健康老人基因组的文章,当日,Nature网站首页对该文章进行了新闻报道,有专家在Nature上表示Cell利用NGS进行研究具有不妥之处。
Cell:利用NGS揭示健康老人的长寿之谜
4月21日发表在Cell上的文章是有史以来最大的健康老人基因组测序的研究。美国加州Scripps转化科学院心脏病学家Eric Topol是该研究的负责人。该项目的研究对象来自南加州退休人员机构以及加州以外的美国地区和其它国家的老年志愿者参,共计511名,他们均未服用任何药物。“这些老人非常敏捷,他们从不住院,因此很难在医疗中心找到他们”,研究人员表示。此外,该研究还以代表普通人群的686名老年人作为对照组(对照组的基因测定都来自其它研究项目),旨在是寻找这些老寿星基因的“与众不同”之处,与其他未达到这般年龄的人或受医疗干预控制(如药物控制血压和胆固醇)的老人相比,老寿星的基因有何差异。
该研究长达八年,作者表示最大的挑战是如何用简单的方法辨别出长寿老人无自身免疫性疾病、血栓、癌症、糖尿病、老年痴呆、心脏病、肾衰竭或中风等疾病的困扰。最后,研究人员发现,作为一个群体,老寿星的阿尔兹海默症和冠状动脉疾病的遗传风险比对照组低,但糖尿病和癌症的风险相似。更有意思的是,该研究还发现了10名老寿星志愿者携带了罕见的基因突变——COL25A1,该基因与阿尔兹海默症相关的大脑斑块有关,而对照组中没有任何一名携带该基因。尽管该结果没有统计学意义,但研究人员认为这可能是少数老年人所以不会患老年性痴呆的关键原因。
本研究的另外一位作者表示,“我们并没有找到健康长寿的灵丹妙药,但我们在一些常见及罕见变异位点中发现了较弱的信号,表明了预防认知功能下降有助于健康老龄化。”
Nature的不同声音
Cell上的研究认为健康老年人与那些经受医疗干预的老人在基因上显著不同。然而荷兰莱顿大学医学中心的遗传流行病学家Marian Beekman对此有不同的看法,她说,“平均而言,与普通人相比,这些老寿星均受过高等教育,且已知受教育程度与长寿有关,所以更难分辨老寿星是因基因差异导致的认知能力,或是他们对疾病的风险认知更高,从而能更好的预防。”
此外,Beekman还认为,这项研究显示出了一些旨在理解健康和疾病风险的大型基因测序研究的局限性,她认为这些研究结果完全可以来自单核苷酸多态性分析(SNPs),SNPs是一种比全基因组测序更快更便宜的探索遗传风险的技术。这项研究可能是有史以来最大的病例对照研究,所有的参与者都接受了基因组测序,但与典型的GWAS研究相比,该研究招募的志愿者还是相对少了些。
“研究人员希望通过多样的NGS数据来解释问题,但我们还不知道这些数据在群体遗传学中有何价值,因为没有足够的数据来做出重要的结论。”她最后表示。
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