发布时间:2019-03-26 17:49 原文链接: DNA片断的酶切实验

限制性内切酶是一类能识别双链DNA分子中特异核苷酸序列的DNA水解酶,这类酶的发现和应用可以用于以DNA重组为基础的生物工程技术。


实验方法原理酶切指采用粘末端连接必须对目的DNA分子和载体分子进行酶切以获得相应的粘末端进行连接。
实验材料

DNA片段

试剂、试剂盒

TE缓冲液

仪器、耗材

离心机恒温水浴取液器电泳仪电泳槽紫外观测仪

实验步骤

一、EcoR Ⅰ、Hind Ⅲ单酶切及双酶切


1.  取2支干净、灭菌新Eppendof管,分别按下表加入
 

 A(μl)B(μl)灭菌水1313EcoR Ⅰ缓冲液20Hind Ⅲ缓冲液02λDNA (或质粒DNA )44EcoR Ⅰ10Hind Ⅲ01总体积2020

2.  37℃保温1-4小时。


3.  保温结束后65-70℃10 min 灭活酶(如为热稳定性酶,则用氯仿抽提)。


4.  取2 μl 左右的反应液加入2 μl 电泳加样缓冲液,电泳。

 

二、EcoR Ⅰ、Hind III双酶切


1.  取一支干净、灭菌Eppendof管,按下表加入各种试剂
 

加入试剂体积(μl)灭菌水12MULT buffer2λDNA(或质粒DNA)4EcoR Ⅰ1Hind Ⅲ  1总体积20

 

2.  37℃保温1-2小时。


3.  保温结束后65-70℃10 min 灭活酶(如为热稳定性酶,则用氯仿抽提)。


4.  取2 μl 左右的反应液加入2 μl 电泳加样缓冲液,电泳。

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注意事项

1.  样品加入次序为水、缓冲液、DNA最后为酶,不应颠倒。


2.  加酶步骤要在冰浴中进行,在加酶前应先将水、缓冲液及待切DNA混匀。


3.  反应体积中水的量要尽量少,即反应体系的体积要尽量少,一般水解0.2~1 ug 模板DNA时,应将体积控制在20~30 ul 内。但要保证所加酶的体积不高于总体积的1/10,因为限制性内切酶是保存于50%甘油中的,如加酶体积高于总体积的1/10,则反应液中甘油浓度将大于5%,而此浓度将抑制内切酶活性。


4.  为了控制反应体积和促进反应进行,要求模板DNA的浓度应很高,否则反应体系中DNA浓度太低则将引起酶反应动力学改变、降低酶解效果,此时不得不增加反应体积;而一般为了增加DNA储藏的稳定性,DNA多保存在TE缓冲液中,如反应体系中过多加入模板DNA溶液则势必造成反应体系中EDTA浓度升高,而对酶产生抑制。因此如底物DNA浓度过低则应进行浓缩。

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其他

单酶切操作比较简单,但双酶切如果两种酶所用缓冲液成分不同(主要是盐离子浓度不同)或反应温度不同,这时可以采用如下措施解决:1)先用一种酶切,然后乙醇沉淀回收DNA分子后再用另外一种酶切;2)先进行低盐要求的酶酶切,然后添加盐离子浓度到高盐的酶反应要求,加入第二种酶进行酶切;3)使用通用缓冲液进行双酶切。具体要根据酶的反应要求进行,尽量避免活力损失。