Horvatovich教授在ASMS2024展示创新的PASTAQ管道技术

2024年6月2日至6日在加利福尼亚州阿纳海姆举行的美国质谱学会(ASMS)年会上，来自荷兰格罗宁根大学的计算质谱学教授兼分析生物化学系主任Peter Horvatovich将介绍其研究成果。他的演讲题为“PASTAQ：避免阈值的LC-MS(/MS)数据预处理，用于非靶向蛋白组学和代谢组学分析”。

Horvatovich教授的工作集中于开发一种名为PASTAQ的处理流程，该流程专为处理定量SMS数据设计，适用于广泛的质谱数据分析，包括蛋白质组学和代谢组学。此技术的开发目的是提供一个通用的处理框架，以支持LCMS、CMS数据及更多类型的分离Ms数据，无论是否具备鉴定信息。

在传统的靶向proto mix分析中，研究者通常有一份预定义的蛋白质列表，而质谱仪的设置仅限于收集这些特定蛋白质的信息。然而，在非靶向proto mix或更广泛的分析中，目标是获得尽可能全面的样本信号概览，这意味着所有可检测到的信号都应被全面记录。问题在于，非靶向Throta mix数据中只有一小部分（大约20%到50%）能被识别，剩余的大部分则未能被利用。PASTAQ流程的一个主要目标就是从这些未被识别的特征中提取定量信息，极大地扩展了数据分析的深度和广度。

PASTAQ管道基于C++编写，执行从原始数据处理到峰值检测、保留时间校正、峰匹配以及提供同位素水平或峰水平的定量图的基本步骤。此外，该流程还提供了稳定的定量功能，特别适用于proto mix分析。通过Python绑定，所有这些功能均已向Python环境开放，同时还提供了一个图形用户界面，简化了proto mix分析和视频鉴定的操作过程。

Horvatovich教授的研究不仅推动了科学的发展，也为未来的医学研究和治疗提供了新的可能性。我们期待在ASMS 2024上听到他的更多分享，并看到PASTAQ管道如何改变非靶向蛋白组学和代谢组学的分析方式，提高数据分析的准确性和效率。