发布时间:2013-07-26 13:49 原文链接: Nature新文章绘制油棕榈基因组图谱

  一个由多国科学家组成的研究小组,确定了一种称之为Shell的基因调控了油棕榈树的产量。油棕榈的果实和种子是全球近一半食用植物油的供应源,并且是最有前景的生物燃料来源之一。

  新研究为我们提供了高质量的油棕榈全基因组图谱,并且还搜索了对于科学和工业均极为重要的基因序列。这一付诸多年努力所取得的研究成果,将对农业和环境产生重大的影响。该国际研究小组将两篇研究论文发表在7月25日《自然》(Nature)杂志上。

  “发现Shell基因的调控作用,可使培育者将油棕榈的产量提高近三分之一,这对于世界雨林保护者而言是个极好的消息”马来西亚棕榈油总署(MPOB)署长Choo Yuen May博士说。

  “发现Shell为更集约地利用现有造林地提供了一条明确的路径,因此将减少扩大油棕榈种植地面积对濒危雨林所造成的压力。这是一个重要的环境问题,也是近年来激进主义分子的一个攻击点,”Orion Genomics公司科学共同创始人Robert A. Martienssen博士说。

  “Shell基因突变可以解释油棕榈最重要的一个经济性状:壳厚度与果实大小以及油产量的相关性,”其中一篇Nature论文的第一作者、马来西亚棕榈油总署Rajinder Singh说。

  油棕榈可以分为两个种类:非洲油棕(Elaeis guineensis)和南美洲油棕(Elaeis oleifera)。根据Martienssen博士所说,它们生成了全世界45%食用食物油。棕榈油还是生物燃料应用理想的商业产品,其产生的能量是生成它所消耗能量的9倍。

  Shell基因造成了油棕榈三种已知的壳形式:厚壳、无壳和薄壳(厚壳油棕榈和无壳油棕榈的杂交种)。薄壳油棕榈的Shell等位基因,一个突变,一个正常,是最佳的组合,相比于厚壳每用地面积的油产量要多30%。

  揭示全基因组序列

  研究人员是在绘制非洲和南美洲油棕榈基因组图谱时发现Shell基因的。最新发布的非洲油棕基因组图谱有18亿碱基序列,它包含3.5个基因,其中包括完整的油生物合成基因,以及在富含油的油棕榈果实中高水平表达的其他转录调控子。

  研究人员还生成了南美洲油棕榈的草图序列。两种油棕榈都是棕榈科开花植物,其化石证据可追溯至距今大约1.4-2亿年前的白垩纪。研究人员通过比较两张图谱,推测油棕榈物种是在旧大陆和新大陆分裂处发生了物种分歧。

相关文章

中国科研团队研发出精准检测评估基因组组装新工具

近年来,随着基因测序技术和算法不断发展,大量物种基因组被陆续测序和组装,为相关研究和应用提供重要遗传信息。因此,如何精准检测评估基因组组装质量高低、避免组装错误等非常关键,也备受关注。记者19日从中国......

中国科研团队研发出新工具,精准检测评估基因组组装质量

京10月19日电(记者孙自法)近年来,随着基因测序技术和算法不断发展,大量物种基因组被陆续测序和组装,为相关研究和应用提供重要遗传信息。因此,如何精准检测评估基因组组装质量高低、避免组装错误等非常关键......

科学家分析禽流感在21世纪的流行

10月18日发表在《自然》的一项研究报道了高致病性H5禽流感病毒在生态与演化上的主要变化,包括全球分布的变化。研究结果显示,这些病毒的暴发中心已经扩展到亚洲以外,传播到了非洲和欧洲的部分地区。2021......

Science:全基因组遗传筛选揭示了人类色素沉着的决定因素

斯坦福大学JoannaWysocka团队在Science在线发表题为“Agenome-widegeneticscreenuncoversdeterminantsofhumanpigmentation”......

研究发现广谱抗黑条矮缩病毒新基因

近日,中国农业科学院作物科学研究所玉米遗传改良与新品种选育创新团队发现了一个玉米抗粗缩病新基因ZmGLK36,并深入揭示了该基因编码的转录因子调控玉米抗粗缩病的分子机制,为抗粗缩病玉米育种等作物抗病改......

昆明植物所完成勐腊毛麝香高质量基因组的组装和萜类物质合成相关基因鉴定

近年来,热带传染病登革热盛行,对热带地区群众的生命健康造成威胁。然而,目前用于大面积喷洒以趋避和杀灭蚊虫的化工合成药品对人体和环境均存在二次伤害的风险,因而亟需发展能够有效驱避埃及伊蚊的天然绿色驱蚊产......

无缺口组装!水稻完整参考基因组发布

近日,中国农业科学院深圳农业基因组研究所联合海南崖州湾实验室、中国水稻研究所、中国农科院作物科学研究所和扬州大学等多个单位发布完整的水稻参考基因组,实现了全基因组所有染色体端粒到端粒无缺口组装,为水稻......

破解埃博拉病毒基因组从头起始复制的分子机制

9月12日,中国科学院微生物研究所施一、齐建勋、高福院士团队,在《自然》(Nature)上,发表了题为MolecularmechanismofdenovoreplicationbytheEbolavi......

遗传年龄或可评估自闭症和精神分裂症患者脑组织衰老速度!

自闭症(ASD)和精神分裂症(SCZ)是常见的慢性精神疾病,在行为、遗传学和神经病理学等方面存在相当多的重叠特征,提示自闭症和精神分裂症可能存在共同的神经发病机制。衰老与表观遗传效应的动态变化密切相关......

我国科研团队发布水稻完整参考基因组

水稻是重要的粮食作物,其基因组组装对水稻育种意义重大。23日,记者从中国农业科学院深圳农业基因组研究所获悉,该所联合崖州湾实验室、中国水稻研究所、中国农科院作物科学研究所和扬州大学等多个单位发布完整的......