发布时间:2012-10-26 00:00 原文链接: Nature:99个癌症基因组全面解析

  近日来自美国、澳大利亚、加拿大的研究人员组成的一个国际研究小组报告了一项大规模胰腺癌基因组分析研究的结果,揭示了导致这一癌症潜在突变的复杂性,发现了与之相关的两条新信号途径。这些信息将推动开发出胰腺癌的新早期诊断测试。相关论文在线发表在10月24日的《自然》(Nature)杂志上。

  贝勒医学院Elkins胰腺中心主任、外科学教授William Fisher博士说:“我们现在知道了与胰腺癌相关的每一个基因。这一研究将开创一个照顾胰腺癌患者的全新时代。我们将它视为了解和治疗这一疾病的一个转折点。”

  研究人员对来自142名胰腺癌患者的胰腺肿瘤和正常组织进行了基因组测序。对其中99个信息量丰富的肿瘤进行了全面详细的分析。在这99个肿瘤样品中,研究人员发现了超过2000个突变以及1628个拷贝数变异。其中90%的肿瘤中存在KRAS基因突变,有数百个基因变异仅存在于1-2%的肿瘤中。在拷贝数变异事件中染色体自身结构发生了改变,从而导致了遗传信息缺失或是复制。

  来自昆士兰大学分子生物科学研究所(IMB)Sean Grimmond教授说:“在显微镜下这些肿瘤或许看起来非常相似,但遗传分析的结果表明每个肿瘤都有大量的差异,患者也是如此。这表明所谓的‘胰腺癌’ 并不是一种而是多种疾病,看似罹患相同癌症的人或许应该给予完全不同的治疗。”

  此外,研究人员还发现一些基因突变与染色质修饰和轴突导向有关。Fisher说:“这是一类从前未知与胰腺癌有关联的基因。我们正准备跳转到这一基因名单,做一些令人兴奋的事情。”

  胰腺癌研究领域将欣然接受这一新信息。胰腺癌是第四位的癌症死亡原因,5年生存率低于5%,在过去的50年患者生存均未获得实质上的改善。

  新研究是首次报道来自这一疾病原发性肿瘤的研究结果。由于这些肿瘤很少,过去只有利用细胞系或移植到小鼠的肿瘤来开展研究。“因此它需要新的技术敏感地鉴别对癌症形成至关重要的突变。这一大型的多中心研究选择了获得极好注释的癌症患者群,这对于此类研究极其重要,为开发出新治疗策略指引了途径,”贝勒医学院人类基因组测序中心副教授avid Wheeler说。

相关文章

新方法实现胰腺癌循环肿瘤细胞多维度解析

近日,中国科学院广州生物医药与健康研究院研究员林达团队与上海市第一人民医院实验动物中心主任杨玉琴团队开发出单细胞多组学技术-UniformChromosomeConformationCapture(U......

基因组大数据还原野猪横跨欧亚的百万年迁徙历程

近日,中国农业科学院农业基因组研究所农业基因编辑技术创新团队深入解析了中亚野猪种群在跨越欧亚大陆百万年的迁徙历程中适应环境的独特遗传密码,为理解大型哺乳动物如何应对环境变化提供了全新视角。相关研究成果......

基因组密码被解锁:深度学习模型破解非编码区奥秘

人类基因组中超98%的遗传变异位于非编码区,这些变异通过调控染色质可及性、三维构象、剪接加工等多种分子机制影响基因表达,最终导致疾病发生。由于调控机制的复杂性和细胞类型特异性,目前解读非编码变异的分子......

中山大学团队研究发现诱发癌症发展新机制

中山大学肿瘤防治中心教授林东昕、研究员郑健团队研究发现,心理压力应激可通过激活交感神经系统释放去甲肾上腺素,作用于肿瘤细胞ADRB2受体,介导肿瘤RNAm6A去甲基化酶ALKBH5表达降低,引发肿瘤细......

“女娲”基因组计划发布第八项成果

近日,中国科学院生物物理研究所徐涛研究组和何顺民研究组在《基因组、蛋白质组与生物信息学报》杂志发表论文。两位科学家牵头的“女娲”中国人群基因组计划旨在构建中国人群的全基因组数据资源,支撑中国人群的疾病......

适应雨林?古人类混血?东南亚人群基因组被破译

中外团队历时10年,在东南亚人群基因组研究领域取得里程碑式突破。北京时间14日晚,“东南亚人群基因组计划”首期成果发表在国际期刊《自然》上,东南亚人群的遗传演化之谜被揭开。论文通讯作者之一、中国科学院......

东南亚人群基因组计划首期成果发表

东南亚是全球最重要的人类演化区域之一。该地区人群拥有极高的遗传多样性,但基因组学研究长期缺失,制约了人类环境适应性进化与疾病遗传机制的深度解析,因而被称为全球人类基因组研究“最后一块拼图”。中国科学院......

首个石榴端粒到端粒参考基因组图完成

近日,中国农业科学院郑州果树研究所(以下简称郑果所)特色浆果与干果种质改良课题组在国际期刊《植物生物技术杂志》(PlantBiotechnologyJournal)上发表研究论文,该研究组装了首个石榴......

中国农大团队构建首个苹果属图形泛基因组

中国农业大学教授韩振海团队基于30份苹果属植物高质量基因组,系统解析了苹果属数千万年的演化历程,并构建了首个苹果属图形泛基因组,发布了苹果属遗传多样性全景图。日前,相关研究成果发表于《自然-遗传学》。......

假根羽藻适应潮间带环境的基因组进化研究获进展

假根羽藻(Bryopsiscorticulans)是在北温带海洋潮间带广泛分布的大型绿藻。假根羽藻生存需适应不断变化的潮汐、温度和紫外线辐射等环境因素。涨潮时,假根羽藻的光合蛋白可在蓝绿光和绿光为主的......